RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506464.5

ABCC3-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, human

TSL 4

Gene ABCC3, Length 540 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC3-208	ENST00000506464	OFD1	O75665	1012 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	CSPG5	O95196	566 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	RPA1	P27694	616 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	TTC38	Q5R3I4	469 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	SNX21	Q969T3	373 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	RSAD1	Q9HA92	442 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	CLEC1B	Q9P126	229 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	HCST	Q9UBK5	93 aa		13.59	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
ABCC3-208	ENST00000506464	POTEM	A6NI47	508 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	LAD1	O00515	517 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	GLP2R	O95838	553 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	ATP2B1	P20020	1258 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	COL9A1	P20849	921 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	ARL2	P36404	184 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	CASP10	Q92851	521 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	IRAK3	Q9Y616	596 aa		13.58	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	ZBTB39	O15060	712 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	INPPL1	O15357	1258 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	DCX	O43602	365 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	TSPAN1	O60635	241 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	ITGA4	P13612	1032 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	TEC	P42680	631 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	CAPS	Q13938	189 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	KCNC3	Q14003	757 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	PDIA5	Q14554	519 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	CLUL1	Q15846	466 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	IGSF21	Q96ID5	467 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	CSRNP2	Q9H175	543 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	CD320	Q9NPF0	282 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		13.57	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	PRR33	A8MZF0	331 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	PER2	O15055	1255 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	NR1I2	O75469	434 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	ALDH2	P05091	517 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	GALT	P07902	379 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	CTSA	P10619	480 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	GLRA2	P23416	452 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	PPP2R5A	Q15172	486 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF174	Q15697	407 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	UBXN11	Q5T124	520 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	LPP	Q93052	612 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464		H3BQV1	296 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	MED24	O75448	989 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	PBX3	P40426	434 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	PRPH	P41219	470 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	ITIH3	Q06033	890 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	NBR1	Q14596	966 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ABCC3-208	ENST00000506464	FAM187B	Q17R55	369 aa		13.55	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms