RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-212ENST00000492539 ATAT1Q5SQI0 421 aa22.25■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 UBXN11Q5T124 520 aa22.25■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 KANK3Q6NY19 840 aa22.25■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 C4orf19Q8IY42 314 aa22.25■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.25■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 HAS1Q92839 578 aa22.25■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 GBP3Q9H0R5 595 aa22.25■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.25■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 STK39Q9UEW8 545 aa22.25■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 USTQ9Y2C2 406 aa22.25■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 STK36Q9NRP7 1315 aa22.25■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 MYO15AQ9UKN7 3530 aa22.24■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 PLXNA3P51805 1871 aa22.24■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 DDHD2O94830 711 aa22.24■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 SEC24BO95487 1268 aa22.24■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 EPHA7Q15375 998 aa22.24■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.24■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 URGCPQ8TCY9 931 aa22.24■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 TMEM143Q96AN5 459 aa22.24■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 TMEM175Q9BSA9 504 aa22.24■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 RSAD1Q9HA92 442 aa22.24■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.24■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa22.24■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 GAS2O43903 313 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 CDKL5O76039 1030 aa22.23■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.23■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 PLCD3Q8N3E9 789 aa22.23■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 FEZF2Q8TBJ5 459 aa22.23■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 LXNQ9BS40 222 aa22.23■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa22.23■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 KANSL3Q9P2N6 904 aa22.23■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 LILRB3O75022 631 aa22.22■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.22■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 YWHABP31946 246 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.22■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 CABP7Q86V35 215 aa22.22■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 OXER1Q8TDS5 423 aa22.22■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 KLHL5Q96PQ7 755 aa22.22■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 SMOC2Q9H3U7 446 aa22.22■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 SFXN1Q9H9B4 322 aa22.22■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 FAM86C1Q9NVL1 165 aa22.22■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 ASAP2O43150 1006 aa22.21■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 ASGR2P07307 311 aa22.21■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 CLCN4P51793 760 aa22.21■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 ANAPC15P60006 121 aa22.21■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 EMC2Q15006 297 aa22.21■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 TMC5Q6UXY8 1006 aa22.21■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.21■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 GPR149Q86SP6 731 aa22.21■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 FERMT3Q86UX7 667 aa22.21■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 POTEDQ86YR6 584 aa22.21■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 TCP11Q8WWU5 503 aa22.21■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa22.21■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 GJB4Q9NTQ9 266 aa22.21■■□□□ 1.15
NELFE-212ENST00000492539 NRP1O14786 923 aa22.2■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 ALDH2P05091 517 aa22.2■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 CNPP09543 421 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 XBP1P17861 261 aa22.2■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 NCAPH2Q6IBW4 605 aa22.2■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 OTUD6AQ7L8S5 288 aa22.2■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 RNF149Q8NC42 400 aa22.2■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 CNNM3Q8NE01 707 aa22.2■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 DYDC2Q96IM9 177 aa22.2■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa22.2■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 MARCH5Q9NX47 278 aa22.2■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 RGL1Q9NZL6 768 aa22.2■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 LIMD1Q9UGP4 676 aa22.2■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 FAN1Q9Y2M0 1017 aa22.2■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 CFAP54Q96N23 3096 aa22.2■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 DMDP11532 3685 aa22.19■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 INPPL1O15357 1258 aa22.19■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 ST18O60284 1047 aa22.19■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 PFKFB2O60825 505 aa22.19■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 POMCP01189 267 aa22.19■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 SOD2P04179 222 aa22.19■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 XKR9Q5GH70 373 aa22.19■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 TMEM105Q8N8V8 129 aa22.19■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 MTRQ99707 1265 aa22.19■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 UBN1Q9NPG3 1134 aa22.19■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.19■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.19■■□□□ 1.14
NELFE-212ENST00000492539 ZBTB39O15060 712 aa22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms