RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488687.5

PSME4-209, Transcript of proteasome activator subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene PSME4, Length 3,073 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4-209ENST00000488687 ABL1P00519 1130 aa6.71□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 UCHL3P15374 230 aa6.71□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 PON1P27169 355 aa6.71□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 ARHGAP25P42331 645 aa6.71□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 MAGEA1P43355 309 aa6.71□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 NPTX2P47972 431 aa6.71□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 VAV2P52735 878 aa6.71□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 NCKAP1LP55160 1127 aa6.71□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 MYBPC2Q14324 1141 aa6.71□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 PPP2R5AQ15172 486 aa6.71□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa6.71□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 FAM160B1Q5W0V3 765 aa6.71□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 XXYLT1Q8NBI6 393 aa6.71□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 DCBLD2Q96PD2 775 aa6.71□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 STRA6Q9BX79 667 aa6.71□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 AZI2Q9H6S1 392 aa6.71□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 C17orf75Q9HAS0 396 aa6.71□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 TXNRD2Q9NNW7 524 aa6.71□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 PLCB1Q9NQ66 1216 aa6.71□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 RBPJLQ9UBG7 517 aa6.71□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 TBX20Q9UMR3 447 aa6.71□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 TFR2Q9UP52 801 aa6.71□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa6.71□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 CARNS1A5YM72 827 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 NOP56O00567 594 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 CNMDO75829 334 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 TRIM49P0CI25 452 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 TRIM49CP0CI26 452 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 FMO5P49326 533 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 SOX10P56693 466 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 MYL7Q01449 175 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 BFSP1Q12934 665 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 Q3C1V9 767 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 SLC9A9Q8IVB4 645 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 KIFC3Q9BVG8 833 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 GANQ9H2C0 597 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 MROH8Q9H579 483 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 NRBP2Q9NSY0 501 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 DMAC2Q9NW81 257 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 HSPBP1Q9NZL4 362 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 TISP43B9A030 160 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 H0YCG3 227 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 FANCGO15287 622 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 GGPS1O95749 300 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 TGFB3P10600 412 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 CYP2C8P10632 490 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 ABL2P42684 1182 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 VAMP7P51809 220 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 ERVK-9P63128 1117 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 CCNA1P78396 465 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 TUBB2AQ13885 445 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 ELF2Q15723 593 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 KCNV1Q6PIU1 500 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 VPS36Q86VN1 386 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 PDCL2Q8N4E4 241 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 SLC7A3Q8WY07 619 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 HLA-CQ95604 372 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 HVCN1Q96D96 273 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 CBWD1Q9BRT8 395 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 TUBB2BQ9BVA1 445 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 PRDM10Q9NQV6 1147 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 FHOD1Q9Y613 1164 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 A0A0G2JMZ2 1700 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 GOLGA8IPA6NC78 632 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 GOLGA8JA6NMD2 632 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 TACC1O75410 805 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 CETPP11597 493 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 ABCD1P33897 745 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 STAT5BP51692 787 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 STRN3Q13033 797 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 EMC2Q15006 297 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 LY6KQ17RY6 165 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 LDLRAD1Q5T700 205 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 CEP112Q8N8E3 955 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 POMGNT1Q8WZA1 660 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 GLG1Q92896 1179 aa6.7□□□□□ -1.34
PSME4-209ENST00000488687 BORCS6Q96GS4 357 aa6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms