RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 IL31RAQ8NI17 732 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC26Q8TAB7 109 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 TNFRSF25Q93038 417 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 MYO1FO00160 1098 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF286BP0CG31 522 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 MAPTP10636 758 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 THPOP40225 353 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 FAM193AP78312 1265 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 IQCB1Q15051 598 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 PTPN21Q16825 1174 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 TAF2Q6P1X5 1199 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 MAIP1Q8WWC4 291 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 RSPH10B2B2RC85 870 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 EXTL3O43909 919 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 RSPH10BP0C881 870 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 SKIP12755 728 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 PSMC6P62333 389 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 PAK2Q13177 524 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 BFSP2Q13515 415 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 GRIK4Q16099 956 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 LRRC4Q9HBW1 653 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 GPR182O15218 404 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 CA12O43570 354 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 CABYRO75952 493 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC144BQ3MJ40 725 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 BRI3BPQ8WY22 251 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 CEP104O60308 925 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 MFSD10Q14728 455 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 ETNPPLQ8TBG4 499 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF653Q96CK0 615 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 IFT122Q9HBG6 1241 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 FRMPD4Q14CM0 1322 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 LGALS2P05162 132 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 CLTAP09496 248 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 KCNJ6P48051 423 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 RBP5P82980 135 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 PPP1R7Q15435 360 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF720Q7Z2F6 126 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 KIFC3Q9BVG8 833 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 SLC38A7Q9NVC3 462 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 TLR2O60603 784 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 ITGA4P13612 1032 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 FLT3LGP49771 235 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM132DQ14C87 1099 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 CFAP221Q4G0U5 840 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 TRIM50Q86XT4 487 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 FAM149B1Q96BN6 582 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC114Q96M63 670 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 PORCNQ9H237 461 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 SETD4Q9NVD3 440 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 TOM1L1O75674 476 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 GARTP22102 1010 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 ELF1P32519 619 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 PSEN2P49810 448 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM270Q6UE05 265 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 GLB1LQ6UWU2 654 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 CLEC4DQ8WXI8 215 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 OGTO15294 1046 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 P4HA2O15460 535 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 TRAPPC3O43617 180 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 TBC1D8O95759 1140 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 ABL1P00519 1130 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 CD4P01730 458 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 FMO5P49326 533 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 KIF11P52732 1056 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 TSPY1Q01534 308 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 CALCOCO2Q13137 446 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 NFRKBQ6P4R8 1299 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 IFNL1Q8IU54 200 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM35BQ8NCS4 154 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 RNF208Q9H0X6 261 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 RBPJLQ9UBG7 517 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1B0GTH6 734 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 NDUFA10O95299 355 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 ANXA13P27216 316 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 ARPP19P56211 112 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRD-211ENST00000486161 JAG1P78504 1218 aa8.9□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms