RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 DUSP6Q16828 381 aa14.47□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 NOMO2Q5JPE7 1267 aa14.47□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 AUTS2Q8WXX7 1259 aa14.47□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 TUFT1Q9NNX1 390 aa14.47□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa14.47□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 MIOSQ9NXC5 875 aa14.47□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 CD207Q9UJ71 328 aa14.47□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 USP20Q9Y2K6 914 aa14.47□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 FAM86C2PA6NEL3 165 aa14.46□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 TTLL13PA6NNM8 815 aa14.46□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 GAS2O43903 313 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 GALTP07902 379 aa14.46□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP14.46□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 CDC25AP30304 524 aa14.46□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 ZP2Q05996 745 aa14.46□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 PTGDRQ13258 359 aa14.46□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa14.46□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 LLGL2Q6P1M3 1020 aa14.46□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 GLB1LQ6UWU2 654 aa14.46□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 TMC7Q7Z402 723 aa14.46□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 BSNDQ8WZ55 320 aa14.46□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 APOL5Q9BWW9 433 aa14.46□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 VN1R3Q9BXE9 311 aa14.46□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 C11orf16Q9NQ32 467 aa14.46□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 CDH22Q9UJ99 828 aa14.46□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 LZTS1Q9Y250 596 aa14.46□□□□□ -0.09
HPS1-211ENST00000478087 PP2D1A8MPX8 630 aa14.45□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 POMCP01189 267 aa14.45□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 SKIP12755 728 aa14.45□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 RPA1P27694 616 aa14.45□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 SLC11A1P49279 550 aa14.45□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 KRT17Q04695 432 aa14.45□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 KCNC3Q14003 757 aa14.45□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 FEZF2Q8TBJ5 459 aa14.45□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 PPP2R3CQ969Q6 453 aa14.45□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 NACC1Q96RE7 527 aa14.45□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 APOL6Q9BWW8 343 aa14.45□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 IPPQ9Y573 584 aa14.45□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 C2orf71A6NGG8 1288 aa14.44□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 C19orf67A6NJJ6 358 aa14.44□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 PI4K2BG5E9Z4 385 aa14.44□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 ERLIN2O94905 339 aa14.44□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 EYA4O95677 639 aa14.44□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 CXCL14O95715 111 aa14.44□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 EDN1P05305 212 aa14.44□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 NCLP19338 710 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 COL9A1P20849 921 aa14.44□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 GJB2P29033 226 aa14.44□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 RAB27AP51159 221 aa14.44□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 POU5F1BQ06416 359 aa14.44□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 COASYQ13057 564 aa14.44□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 TFDP1Q14186 410 aa14.44□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 MCTP1Q6DN14 999 aa14.44□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 KANK3Q6NY19 840 aa14.44□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 PADI6Q6TGC4 694 aa14.44□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 ADHFE1Q8IWW8 467 aa14.44□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 VPS52Q8N1B4 723 aa14.44□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 SMRP1Q8NCR6 262 aa14.44□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 PGBD4Q96DM1 585 aa14.44□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 IGSF21Q96ID5 467 aa14.44□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 ZFP42Q96MM3 310 aa14.44□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 GAD1Q99259 594 aa14.44□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 RSAD1Q9HA92 442 aa14.44□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 KIAA1024Q9UPX6 916 aa14.44□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 PLXNA3P51805 1871 aa14.44□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 DOCK6Q96HP0 2047 aa14.43□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 LRRIQ4A6NIV6 560 aa14.43□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 F8W810 466 aa14.43□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 ITGA4P13612 1032 aa14.43□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 AKAP5P24588 427 aa14.43□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 CA8P35219 290 aa14.43□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 PPM1AP35813 382 aa14.43□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 TRAPPC10P48553 1259 aa14.43□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.43□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 SYCE2Q6PIF2 218 aa14.43□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 SNX21Q969T3 373 aa14.43□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 LRFN3Q9BTN0 628 aa14.43□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 CSRNP2Q9H175 543 aa14.43□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 S1PR5Q9H228 398 aa14.43□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 CXCL16Q9H2A7 254 aa14.43□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
HPS1-211ENST00000478087 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms