RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471202.5

CHTF18-208, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 2

Gene CHTF18, Length 4,494 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-208ENST00000471202 SPC25Q9HBM1 224 aa15.5■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 GOLGA8MH3BSY2 632 aa15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 YWHABP31946 246 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 RUBCNQ92622 972 aa15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 TRIM51Q9BSJ1 452 aa15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 PFDN4Q9NQP4 134 aa15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 BCAP29Q9UHQ4 241 aa15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 NOL3O60936 208 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 LRRC14Q15048 493 aa15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 ZNF699Q32M78 642 aa15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 CATSPER3Q86XQ3 398 aa15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 RPS6KC1Q96S38 1066 aa15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 SMYD2Q9NRG4 433 aa15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 NWD1Q149M9 1564 aa15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 ITKQ08881 620 aa15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 RPS6KA2Q15349 733 aa15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 Q3C1V9 767 aa15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 MORC4Q8TE76 937 aa15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 HOXC10Q9NYD6 342 aa15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 HSPBP1Q9NZL4 362 aa15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 A0A087X0T9 212 aa15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 RAD51CO43502 376 aa15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 ABL1P00519 1130 aa15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 FAM228BP0C875 321 aa15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 SCP2P22307 547 aa15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 GCKP35557 465 aa15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 CAV1Q03135 178 aa15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 VPS72Q15906 364 aa15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 RHOT1Q8IXI2 618 aa15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 MTRQ99707 1265 aa15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 CALB1P05937 261 aa15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 ANXA13P27216 316 aa15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 ECE1P42892 770 aa15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 ARL4CP56559 192 aa15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 SRLQ86TD4 932 aa15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 GPD1LQ8N335 351 aa15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 IL17RAQ96F46 866 aa15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 CFAP36Q96G28 342 aa15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 LRRC4Q9HBW1 653 aa15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 PCSK1NQ9UHG2 260 aa15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 RTN2O75298 545 aa15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 CYP11B2P19099 503 aa15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 SARSP49591 514 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 NUF2Q9BZD4 464 aa15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 ZNF568Q3ZCX4 644 aa15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 RAPH1Q70E73 1250 aa15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 PCGF5Q86SE9 256 aa15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 MMGT1Q8N4V1 131 aa15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 SLC30A5Q8TAD4 765 aa15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 CHMP6Q96FZ7 201 aa15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 GBP5Q96PP8 586 aa15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 ZNF302Q9NR11 478 aa15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 PIM2Q9P1W9 311 aa15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 FGFR4P22455 802 aa15.47■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 IRX4P78413 519 aa15.47■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 SLC10A5Q5PT55 438 aa15.47■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 OR2W6PQ8NHA6 318 aa15.47■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa15.47■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 MAPK13O15264 365 aa15.47■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 OSBPP22059 807 aa15.47■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 ASPHQ12797 758 aa15.47■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 TTC17Q96AE7 1141 aa15.47■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 SHPRHQ149N8 1683 aa15.47■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 TOM1L1O75674 476 aa15.47■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 SERPINB6P35237 376 aa15.47■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 TTC13Q8NBP0 860 aa15.47■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 ZIM3Q96PE6 472 aa15.47■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 TACC3Q9Y6A5 838 aa15.47■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 UBE4BO95155 1302 aa15.47■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 CNGA1P29973 690 aa15.47■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 MDH1P40925 334 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 GPS1Q13098 491 aa15.47■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 BARGINQ6ZT62 677 aa15.47■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 FAF2Q96CS3 445 aa15.47■□□□□ 0.07
CHTF18-208ENST00000471202 HVCN1Q96D96 273 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms