RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 KANSL3Q9P2N6 904 aa22.7■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa22.7■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa22.7■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 TTC3P53804 2025 aa22.69■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa22.69■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 ACKR2O00590 384 aa22.69■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 N4BP3O15049 544 aa22.69■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 TSPAN1O60635 241 aa22.69■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 FAM13AO94988 1023 aa22.69■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 PLS3P13797 630 aa22.69■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 BMPR1AP36894 532 aa22.69■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 AMPD3Q01432 767 aa22.69■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 STRN3Q13033 797 aa22.69■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 PKP1Q13835 747 aa22.69■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.69■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 MYLIPQ8WY64 445 aa22.69■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 CUEDC2Q9H467 287 aa22.69■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.69■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 RCOR1Q9UKL0 485 aa22.69■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.69■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 A0A1B0GUA9 196 aa22.68■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 PRKCBP05771 671 aa22.68■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 LIG1P18858 919 aa22.68■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 CTNNB1P35222 781 aa22.68■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 EPC2Q52LR7 807 aa22.68■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 SLC27A1Q6PCB7 646 aa22.68■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 LRRC43Q8N309 656 aa22.68■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 IQUBQ8NA54 791 aa22.68■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 URGCPQ8TCY9 931 aa22.68■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 ITGA4P13612 1032 aa22.67■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 NPTX2P47972 431 aa22.67■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 MCM6Q14566 821 aa22.67■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 SPATA32Q96LK8 384 aa22.67■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 PARVGQ9HBI0 331 aa22.67■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 FGFR1P11362 822 aa22.66■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 LAG3P18627 525 aa22.66■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.66■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 MYCT1Q8N699 235 aa22.66■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 C17orf80Q9BSJ5 609 aa22.66■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.66■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.66■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.65■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 H3BNC9 293 aa22.65■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 GPM6BQ13491 265 aa22.65■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 BSNDQ8WZ55 320 aa22.65■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 P2RX5Q93086 422 aa22.65■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 CPB2Q96IY4 423 aa22.65■■□□□ 1.22
IMP4-209ENST00000462357 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
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IMP4-209ENST00000462357 SFI1A8K8P3 1242 aa22.64■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 NR1I2O75469 434 aa22.64■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 PPM1AP35813 382 aa22.64■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 KRT17Q04695 432 aa22.64■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
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IMP4-209ENST00000462357 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa22.64■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 USP49Q70CQ1 688 aa22.64■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 CASD1Q96PB1 797 aa22.64■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 PANK2Q9BZ23 570 aa22.64■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 RSAD1Q9HA92 442 aa22.64■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.64■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 POLD4Q9HCU8 107 aa22.64■■□□□ 1.21
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IMP4-209ENST00000462357 GIT1Q9Y2X7 761 aa22.64■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa22.64■■□□□ 1.21
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IMP4-209ENST00000462357 NOMO2Q5JPE7 1267 aa22.63■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 ATF7IP2Q5U623 682 aa22.63■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 DAW1Q8N136 415 aa22.63■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 PDILTQ8N807 584 aa22.63■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 HELQQ8TDG4 1101 aa22.63■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.63■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.63■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 REEP2Q9BRK0 252 aa22.63■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 TCHPQ9BT92 498 aa22.63■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa22.63■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.63■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 SZT2Q5T011 3432 aa22.63■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 COL4A6Q14031 1691 aa22.62■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 SLC16A4O15374 487 aa22.62■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 TRAK2O60296 914 aa22.62■■□□□ 1.21
IMP4-209ENST00000462357 GAP43P17677 238 aa22.62■■□□□ 1.21
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