RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		19.78	■□□□□ 0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		19.78	■□□□□ 0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		19.78	■□□□□ 0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		19.78	■□□□□ 0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	19.78	■□□□□ 0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	CFAP54	Q96N23	3096 aa		19.77	■□□□□ 0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	HIDE1	A8MVS5	230 aa		19.77	■□□□□ 0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	ASAP2	O43150	1006 aa		19.77	■□□□□ 0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	PPM1A	P35813	382 aa		19.77	■□□□□ 0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	TXK	P42681	527 aa		19.77	■□□□□ 0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	19.77	■□□□□ 0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	19.77	■□□□□ 0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	GUCY1B3	Q02153	619 aa		19.77	■□□□□ 0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	KRT17	Q04695	432 aa		19.77	■□□□□ 0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	19.77	■□□□□ 0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	19.77	■□□□□ 0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		19.77	■□□□□ 0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	C8orf76	Q96K31	380 aa		19.77	■□□□□ 0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF558	Q96NG5	402 aa		19.77	■□□□□ 0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	APOL5	Q9BWW9	433 aa		19.77	■□□□□ 0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	19.77	■□□□□ 0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	19.77	■□□□□ 0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	19.77	■□□□□ 0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		19.77	■□□□□ 0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		19.77	■□□□□ 0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	NR2E1	Q9Y466	385 aa		19.77	■□□□□ 0.76
MRPL28-203	ENST00000429738	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		19.76	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	POTEM	A6NI47	508 aa		19.76	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	PBX3	P40426	434 aa		19.76	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	RAB27A	P51159	221 aa		19.76	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		19.76	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		19.76	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	19.76	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		19.75	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	DGAT1	O75907	488 aa		19.75	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	19.75	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		19.75	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	19.75	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	RARRES1	P49788	294 aa		19.75	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	19.75	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		19.75	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	TMC7	Q7Z402	723 aa		19.75	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	19.75	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF149	Q8NC42	400 aa		19.75	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		19.75	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	CASP10	Q92851	521 aa		19.75	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	LPP	Q93052	612 aa		19.75	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	SPG21	Q9NZD8	308 aa		19.75	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM186A	A6NE01	2351 aa		19.75	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738		H0Y858	1186 aa		19.74	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		19.74	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	19.74	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	19.74	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	MCM7	P33993	719 aa		19.74	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	PTEN	P60484	403 aa		19.74	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	POU5F1B	Q06416	359 aa		19.74	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	19.74	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	19.74	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	CES5A	Q6NT32	575 aa		19.74	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	19.74	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		19.74	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	19.74	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		19.74	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		19.74	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	19.73	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	OFD1	O75665	1012 aa		19.73	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	ARL2	P36404	184 aa		19.73	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	BCAR1	P56945	870 aa		19.73	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	ITIH3	Q06033	890 aa		19.73	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	UBXN11	Q5T124	520 aa		19.73	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		19.73	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		19.73	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		19.73	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		19.72	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	PROB1	E7EW31	1015 aa		19.72	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP2B1	P20020	1258 aa		19.72	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	19.72	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		19.72	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		19.72	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		19.72	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		19.72	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		19.72	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		19.72	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	PGBD4	Q96DM1	585 aa		19.72	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		19.72	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		19.72	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		19.72	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		19.72	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	CDH22	Q9UJ99	828 aa		19.72	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		19.72	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	CARNS1	A5YM72	827 aa		19.71	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		19.71	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	19.71	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	OR52Z1	P0C646	297 aa		19.71	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	AXL	P30530	894 aa		19.71	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAPPC10	P48553	1259 aa		19.71	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	19.71	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	MTMR3	Q13615	1198 aa		19.71	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	CAPS	Q13938	189 aa		19.71	■□□□□ 0.75
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF174	Q15697	407 aa		19.71	■□□□□ 0.75

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