RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409911.5

LRRTM4-205, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,976 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-205ENST00000409911 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 NEDD4P46934 1319 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 MYH13Q9UKX3 1938 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 E7ENQ6 273 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 IKBKBO14920 756 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 MUSKO15146 869 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 COL6A2P12110 1019 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 GYS1P13807 737 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 RFC4P35249 363 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 STAT3P40763 770 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 MDH1P40925 334 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 RPS8P62241 208 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 RELAQ04206 551 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 GNA13Q14344 377 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 MYLK3Q32MK0 819 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 TRAPPC3LQ5T215 181 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 NT5DC4Q86YG4 428 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 LSMEM1Q8N8F7 131 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 MTMR12Q9C0I1 747 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 HACD3Q9P035 362 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 HPS5Q9UPZ3 1129 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 LEMD3Q9Y2U8 911 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 TRIM17Q9Y577 477 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 IRS2Q9Y4H2 1338 aa7.25□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 UBE2Q2LH0YL09 131 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 H3BQV1 296 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 RASA4O43374 803 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 FDPSP14324 419 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 AP2B1P63010 937 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 ATP11AP98196 1134 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 HSPA14Q0VDF9 509 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 RALGDSQ12967 914 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 ANKRD1Q15327 319 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 TTMPQ5BVD1 217 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 TJAP1Q5JTD0 557 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 IFFO2Q5TF58 517 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 ZNF449Q6P9G9 518 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 RASGRP2Q7LDG7 609 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 CCNJLQ8IV13 435 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 MLKLQ8NB16 471 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 OR7G1Q8NGA0 311 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 SERHL2Q9H4I8 314 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 MOCS1Q9NZB8 636 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 NDUFA13Q9P0J0 144 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 AGAP1Q9UPQ3 857 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 SNX9Q9Y5X1 595 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 ANKRD34BA5PLL1 514 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 HOXA2O43364 376 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 NQO1P15559 274 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 RXRAP19793 462 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 SERPINB3P29508 390 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 ARFIP2P53365 341 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 GRIK5Q16478 980 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 ODF2Q5BJF6 829 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 PRR5LQ6MZQ0 368 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 IFNL3Q8IZI9 196 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 SDR42E1Q8WUS8 393 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 ARL8AQ96BM9 186 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 NLRP3Q96P20 1036 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 MTMR9Q96QG7 549 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 C12orf4Q9NQ89 552 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 HDAC9Q9UKV0 1011 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 CHD4Q14839 1912 aa7.24□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa7.23□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 GMNCA6NCL1 334 aa7.23□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 LRRC72A6NJI9 287 aa7.23□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 B4E1Z4 1266 aa7.23□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 H0YC42 278 aa7.23□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 ZNF213O14771 459 aa7.23□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 STRNO43815 780 aa7.23□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 KPNA6O60684 536 aa7.23□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 CBFA2T3O75081 653 aa7.23□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 ZBED1O96006 694 aa7.23□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 KCNA3P22001 575 aa7.23□□□□□ -1.25
LRRTM4-205ENST00000409911 USP14P54578 494 aa7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms