RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396667.7

TMEM106B-201, Transcript of transmembrane protein 106B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM106B, Length 12,539 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106B-201ENST00000396667 CHSY1Q86X52 802 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 DGKHQ86XP1 1220 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 POTEDQ86YR6 584 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 TRIM7Q9C029 511 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 FAM49BQ9NUQ9 324 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 STAP2Q9UGK3 403 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 CEP104O60308 925 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 ODC1P11926 461 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 GRIK4Q16099 956 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 KCNA10Q16322 511 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 ATF7IP2Q5U623 682 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 C12orf60Q5U649 245 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 HAUS1Q96CS2 278 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 DCUN1D1Q96GG9 259 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 FSD1LQ9BXM9 530 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 UNC93B1Q9H1C4 597 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 PCDHB8Q9UN66 801 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 GAS2O43903 313 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 HBP1O60381 514 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 EPB42P16452 691 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 AKT1P31749 480 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 CYP2C18P33260 490 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 ATAT1Q5SQI0 421 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 ANKRD40Q6AI12 368 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 PHACTR4Q8IZ21 702 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 HELQQ8TDG4 1101 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 TRPV2Q9Y5S1 764 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 CLTBP09497 229 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 HADHAP40939 763 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 TEKT4Q8WW24 435 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 CHST12Q9NRB3 414 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 SLC38A7Q9NVC3 462 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 MTMR4Q9NYA4 1195 aa4.76□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 NPEPPSP55786 919 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 ATP11AP98196 1134 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 NR5A1Q13285 461 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 CCDC144BQ3MJ40 725 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 EFHC2Q5JST6 749 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 APOA5Q6Q788 366 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 FMNL3Q8IVF7 1028 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 GPD1LQ8N335 351 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 PLEKHF1Q96S99 279 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 CTAGE9A4FU28 777 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 ABCD1P33897 745 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 MTMR3Q13615 1198 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 KYNUQ16719 465 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 LONRF2Q1L5Z9 754 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 MEI1Q5TIA1 1274 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 DOK6Q6PKX4 331 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 RAB42Q8N4Z0 105 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 RSPH1Q8WYR4 309 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 SLITRK1Q96PX8 696 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 E5RI56 91 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 HIP1RO75146 1068 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 CALRP27797 417 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 SARNPP82979 210 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 SEMA3FQ13275 785 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 VPS52Q8N1B4 723 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 EHBP1Q8NDI1 1231 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 EGFL8Q99944 293 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 CREBZFQ9NS37 354 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 RGL1Q9NZL6 768 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 MBD5Q9P267 1494 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 F8W8V4 182 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 ZW10O43264 779 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 KIAA0754O94854 1291 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 VIMP08670 466 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 AKAP5P24588 427 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 RGS7P49802 495 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 KDSRQ06136 332 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 CCL14Q16627 93 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 EXOC3L4Q17RC7 722 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 FRA10AC1Q70Z53 315 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 CGRRF1Q99675 332 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 TCF25Q9BQ70 676 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 EHD2Q9NZN4 543 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 TDP2O95551 362 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 PCP11498 1178 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 ACOT2P49753 483 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 BPIFB4P59827 614 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 LBRQ14739 615 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 NOTUMQ6P988 496 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 TLL2Q9Y6L7 1015 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 CPS1P31327 1500 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 ZNF263O14978 683 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 ITGA7Q13683 1181 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 KCNH7Q9NS40 1196 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 SENP1Q9P0U3 644 aa4.75□□□□□ -1.65
TMEM106B-201ENST00000396667 PYGMP11217 842 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms