RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348333.7

TNFRSF25-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF25, Length 1,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25-201ENST00000348333 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
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TNFRSF25-201ENST00000348333 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF25-201ENST00000348333 B4GALT5O43286 388 aa25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF25-201ENST00000348333 ERLIN2O94905 339 aa25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF25-201ENST00000348333 EYA4O95677 639 aa25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF25-201ENST00000348333 COL9A1P20849 921 aa25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF25-201ENST00000348333 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
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TNFRSF25-201ENST00000348333 ECM1Q16610 540 aa25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF25-201ENST00000348333 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF25-201ENST00000348333 ADHFE1Q8IWW8 467 aa25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM50BQ9Y247 325 aa25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF25-201ENST00000348333 HES2Q9Y543 173 aa25.27■■□□□ 1.64
TNFRSF25-201ENST00000348333 PI4K2BG5E9Z4 385 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF25-201ENST00000348333 DDHD2O94830 711 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF25-201ENST00000348333 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC11A1P49279 550 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF25-201ENST00000348333 KRT17Q04695 432 aa25.26■■□□□ 1.63
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TNFRSF25-201ENST00000348333 LLGL2Q6P1M3 1020 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMC7Q7Z402 723 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF25-201ENST00000348333 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF25-201ENST00000348333 AUTS2Q8WXX7 1259 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF25-201ENST00000348333 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF25-201ENST00000348333 VN1R3Q9BXE9 311 aa25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF25-201ENST00000348333 RNF39Q9H2S5 420 aa25.26■■□□□ 1.63
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TNFRSF25-201ENST00000348333 PRKAG3Q9UGI9 489 aa25.26■■□□□ 1.63
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TNFRSF25-201ENST00000348333 PGBD4Q96DM1 585 aa25.25■■□□□ 1.63
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TNFRSF25-201ENST00000348333 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa25.25■■□□□ 1.63
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TNFRSF25-201ENST00000348333 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP25.24■■□□□ 1.63
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TNFRSF25-201ENST00000348333 NCLP19338 710 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
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TNFRSF25-201ENST00000348333 TMEM169Q96HH4 297 aa25.24■■□□□ 1.63
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TNFRSF25-201ENST00000348333 SYCE2Q6PIF2 218 aa25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF25-201ENST00000348333 VPS52Q8N1B4 723 aa25.22■■□□□ 1.63
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TNFRSF25-201ENST00000348333 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF25-201ENST00000348333 ANKRD54Q6NXT1 300 aa25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa25.2■■□□□ 1.62
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TNFRSF25-201ENST00000348333 RSPH1Q8WYR4 309 aa25.2■■□□□ 1.62
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