RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319190.9

TTC7A-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TTC7A, Length 5,157 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7A-201ENST00000319190 GINM1Q9NU53 330 aa22.16■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 MAFGO15525 162 aa22.15■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.15■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 FAF2Q96CS3 445 aa22.15■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 SLC4A1P02730 911 aa22.15■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 KRT7P08729 469 aa22.15■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 SRGNP10124 158 aa22.15■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 IRX4P78413 519 aa22.15■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 SEPT6Q14141 434 aa22.15■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.15■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 KIF12Q96FN5 646 aa22.15■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.15■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 IP6K2Q9UHH9 426 aa22.15■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 GCNAQ96QF7 691 aa22.15■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 NUDCD1Q96RS6 583 aa22.15■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.15■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 KIF9Q9HAQ2 790 aa22.15■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.14■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 EPHB1P54762 984 aa22.14■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 ARL4CP56559 192 aa22.14■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.14■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 CFAP61Q8NHU2 1237 aa22.14■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 CA4P22748 312 aa22.14■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.14■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.14■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.14■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 CFAP36Q96G28 342 aa22.14■■□□□ 1.14
TTC7A-201ENST00000319190 USP27XA6NNY8 438 aa22.14■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 CSPG5O95196 566 aa22.14■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 PLS3P13797 630 aa22.14■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 ZNF560Q96MR9 790 aa22.14■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 LIG3P49916 1009 aa22.14■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 IFT88Q13099 833 aa22.14■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 TMEM143Q96AN5 459 aa22.14■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 SAYSD1Q9NPB0 183 aa22.14■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 MID2Q9UJV3 735 aa22.14■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 A8MXQ7 604 aa22.13■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 PCSK1NQ9UHG2 260 aa22.13■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa22.13■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 NCK2O43639 380 aa22.13■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 SLC25A27O95847 323 aa22.13■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 RHOT1Q8IXI2 618 aa22.13■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.134e-6■□□□□ 9
TTC7A-201ENST00000319190 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.13■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa22.13■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 GOLGA8OA6NCC3 632 aa22.13■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 GOLGA8NF8WBI6 632 aa22.13■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 EXOC4Q96A65 974 aa22.13■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.13■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa22.13■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 HEY1Q9Y5J3 304 aa22.13■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 GRID2IPA4D2P6 1211 aa22.13■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 EVI5O60447 810 aa22.13■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.13■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 DCLK2Q8N568 766 aa22.13■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 ATG4CQ96DT6 458 aa22.13■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 AGPAT1Q99943 283 aa22.13■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.13■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 MTF1Q14872 753 aa22.12■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 URGCPQ8TCY9 931 aa22.12■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 ACAP3Q96P50 834 aa22.12■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 MMEL1Q495T6 779 aa22.12■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.12■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 ITIH6Q6UXX5 1313 aa22.12■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.12■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 CAV1Q03135 178 aa22.12■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 NFIAQ12857 509 aa22.12■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 ATP6V1E2Q96A05 226 aa22.12■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 SLIT1O75093 1534 aa22.12■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 CHST13Q8NET6 341 aa22.12■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 APEX2Q9UBZ4 518 aa22.12■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa22.11■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 KRT37O76014 449 aa22.11■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 CHRNA3P32297 505 aa22.11■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 FMO5P49326 533 aa22.11■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 CDC42EP1Q00587 391 aa22.11■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.11■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa22.11■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 STK33Q9BYT3 514 aa22.11■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 PXDNQ92626 1479 aa22.11■■□□□ 1.13
TTC7A-201ENST00000319190 CYP26A1O43174 497 aa22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms