RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000165953.2

Nelfe-202, Transcript of Negative elongation factor E, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nelfe, Length 1,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Nup210Q9QY81 1886 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 NrlP54846 237 aa25.26■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 PrkcbP68404 671 aa25.26■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 St18Q80TY4 1045 aa25.26■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 AtripQ8BMG1 785 aa25.26■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cabp7Q91ZM8 215 aa25.26■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Lmod3E9QA62 571 aa25.25■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Gm11236J3QMS7 360 aa25.25■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Nr1i2O54915 431 aa25.25■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Defa-rs2P17534 91 aa25.25■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Myadml2Q08AU7 307 aa25.25■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Plpp4Q0VBU9 271 aa25.25■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cyb5r4Q3TDX8 528 aa25.25■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Prpf4bQ61136 1007 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Gpc3Q8CFZ4 579 aa25.25■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Matr3Q8K310 846 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 TraipQ8VIG6 470 aa25.25■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Plcb1Q9Z1B3 1216 aa25.25■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Krt85Q9Z2T6 507 aa25.25■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Aimp1P31230 310 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Skap1Q3UUV5 355 aa25.24■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Akap7Q7TN79 314 aa25.24■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Nol12Q8BG17 217 aa25.24■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Rsl1d1Q8BVY0 452 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Kdm4cQ8VCD7 1054 aa25.24■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Lman1Q9D0F3 517 aa25.24■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Dnajb4Q9D832 337 aa25.24■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Clic4Q9QYB1 253 aa25.24■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ttc3O88196 1979 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Efna5O08543 228 aa25.23■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Nat8lQ3UGX3 299 aa25.23■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Gm28047Q3US59 414 aa25.23■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Dzip3Q7TPV2 1204 aa25.23■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Lrrd1Q8C0R9 853 aa25.23■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Csde1Q91W50 798 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Vps16Q920Q4 839 aa25.23■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Gdpd2Q9ESM6 539 aa25.23■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Pla2g2fQ9QZT4 168 aa25.23■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Gm45713A0A1B0GS68 446 aa25.22■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 DohhA0A1Y7VJ29 135 aa25.22■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 P01734 135 aa25.22■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Tal1P22091 329 aa25.22■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Grin1P35438 938 aa25.22■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cpa2Q504N0 417 aa25.22■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ccdc125Q5U465 500 aa25.22■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 PtprjQ64455 1238 aa25.22■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 PccaQ91ZA3 724 aa25.22■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 NaspQ99MD9 773 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Scrn1Q9CZC8 414 aa25.22■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 GatmQ9D964 423 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Doc2gQ9ESN1 387 aa25.22■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Akr1a1Q9JII6 325 aa25.22■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Stx6Q9JKK1 255 aa25.22■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Arl6ip4Q9JM93 229 aa25.22■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Vmn2r121A2BE32 847 aa25.21■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Zfp651E9PZ11 729 aa25.21■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Vmn2r78K7N6U5 853 aa25.21■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Mdm4O35618 489 aa25.21■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 GaltQ03249 379 aa25.21■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Olfml2bQ3V1G4 746 aa25.21■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Znrf3Q5SSZ7 913 aa25.21■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Leo1Q5XJE5 667 aa25.21■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Armcx2Q6A058 784 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Znf365Q8BG89 408 aa25.21■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Washc1Q8VDD8 475 aa25.21■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Umodl1Q5DID3 1319 aa25.21■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Krt78E9Q0F0 1068 aa25.2■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ap1b1O35643 943 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Cacna2d4Q5RJF7 1116 aa25.2■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 ItgaeQ60677 1167 aa25.2■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Slc26a2Q62273 739 aa25.2■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ccdc66Q6NS45 935 aa25.2■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Rexo1Q7TT28 1213 aa25.2■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Kank2Q8BX02 843 aa25.2■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Eif2b5Q8CHW4 717 aa25.2■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Fbxo18Q8K2I9 1042 aa25.2■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Tada3Q8R0L9 432 aa25.2■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Trim11Q99PQ2 467 aa25.2■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Gde1Q9JL56 331 aa25.2■■□□□ 1.63
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Tatdn2B7ZNL9 783 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Gm8369E9PZI3 166 aa25.19■■□□□ 1.62
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ercc5P35689 1170 aa25.19■■□□□ 1.62
Nelfe-202ENSMUST00000165953 PolrmtQ8BKF1 1207 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ccdc71Q8VEG0 433 aa25.19■■□□□ 1.62
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Acot11Q8VHQ9 594 aa25.19■■□□□ 1.62
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Krt23Q99PS0 422 aa25.19■■□□□ 1.62
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Slc26a4Q9R155 780 aa25.19■■□□□ 1.62
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Dpep1P31428 410 aa25.18■■□□□ 1.62
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Snx25Q3ZT31 840 aa25.18■■□□□ 1.62
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Xpnpep1Q6P1B1 623 aa25.18■■□□□ 1.62
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Znf653Q6YND2 615 aa25.18■■□□□ 1.62
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Vps52Q8C754 723 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Dhx30Q99PU8 1217 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Smc1aQ9CU62 1233 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Ndufaf7Q9CWG8 436 aa25.18■■□□□ 1.62
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Drap1Q9D6N5 205 aa25.18■■□□□ 1.62
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Homer2Q9QWW1 354 aa25.18■■□□□ 1.62
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Hebp1Q9R257 190 aa25.18■■□□□ 1.62
Nelfe-202ENSMUST00000165953 Tp53bp1P70399 1969 aa25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24 ms