RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	SUS1	Q6WNK7	96 aa		5.19	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	HFA1	P32874	2273 aa		5.19	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	PRP28	P23394	588 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	TRS65	P32893	560 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	SLC1	P33333	303 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	NIC96	P34077	839 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	CLG1	P35190	452 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	CHL4	P38907	458 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	DDI1	P40087	428 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	PKP1	P40530	394 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	COS10	P52924	374 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	CUZ1	P53899	274 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	DML1	Q03652	475 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	OST6	Q03723	332 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	SNO4	Q04902	237 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	YLR040C	Q07988	224 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	YPL278C	Q08990	100 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	HSP32	Q08992	237 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	YDL109C	Q12103	647 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	SET6	Q12529	373 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.18	□□□□□ -1.58	not detected
AMD1	YML035C	YPK2	P18961	677 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	SEC62	P21825	274 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	MDL1	P33310	695 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	GPX1	P36014	167 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	YKL077W	P36081	392 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	YKL071W	P36086	256 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	YKR073C	P36153	106 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	SKN7	P38889	622 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	SER3	P40054	469 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	IRC7	P43623	340 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	ECL1	P48235	211 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	EKI1	Q03764	534 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	PLM2	Q04383	521 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	BUR2	Q05949	395 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	COQ10	Q08058	207 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	YOL024W	Q08172	172 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	MDM32	Q12171	622 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		5.18	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	KIN28	P06242	306 aa		5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	PHO80	P20052	293 aa		5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	NUP1	P20676	1076 aa		5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	HSP30	P25619	332 aa		5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	SPT14	P32363	452 aa		5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	SUR1	P33300	382 aa		5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	MSN4	P33749	630 aa		5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	RPP1	P38786	293 aa		5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	NVJ1	P38881	321 aa		5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	BUR6	P40096	142 aa		5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	BNA6	P43619	295 aa		5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	BUD17	P53727	317 aa		5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	ATG21	Q02887	496 aa		5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	PFA5	Q03289	374 aa		5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	PDE2	P06776	526 aa		5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	YCR102C	P25608	368 aa		5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	YBR242W	P38331	238 aa		5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.17	□□□□□ -1.58	not detected
AMD1	YML035C	ATG18	P43601	500 aa		5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	IKS1	P47042	667 aa		5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	BUD9	P53226	547 aa		5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	YNR062C	P53748	327 aa		5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	YDR249C	Q03787	373 aa		5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	MRPL1	Q04599	285 aa		5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	CYK3	Q07533	885 aa		5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	RLM1	Q12224	676 aa		5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	YDL177C	Q12257	170 aa		5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	WHI5	Q12416	295 aa		5.17	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	SEC12	P11655	471 aa		5.16	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	ATG22	P25568	528 aa		5.16	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	CPR3	P25719	182 aa		5.16	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	RPC34	P32910	317 aa		5.16	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	SEF1	P34228	1148 aa		5.16	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	RSM22	P36056	628 aa		5.16	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	YHR180W	P38868	163 aa		5.16	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	MLH1	P38920	769 aa		5.16	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	HPA3	P39979	161 aa		5.16	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	YFR054C	P43622	192 aa		5.16	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	IRC18	P47056	224 aa		5.16	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	PGU1	P47180	361 aa		5.16	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	NUP53	Q03790	475 aa		5.16	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	YLR173W	Q06247	608 aa		5.16	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	SSK1	Q07084	712 aa		5.16	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	PCL9	Q12477	304 aa		5.16	□□□□□ -1.58
AMD1	YML035C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58

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