RNA–Protein interactions for RNA: YJL054W

TIM54, Transcript of Component of the mitochondrial TIM22 complex, yeastyeast

Gene TIM54, Length 1,437 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIM54YJL054W YDL199CQ12407 687 aa4.79□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W RNA1P11745 407 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W ERD2P18414 219 aa4.78□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W REC107P21651 314 aa4.78□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W SAN1P22470 610 aa4.78□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W PUP2P32379 260 aa4.78□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W HIR2P32480 875 aa4.78□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W HIS7P33734 552 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W MRPL39P36533 70 aa4.78□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W YNL195CP40168 261 aa4.78□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W HXT9P40885 567 aa4.78□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W NIT2P47016 307 aa4.78□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W BUL1P48524 976 aa4.78□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W YNL181WP53878 407 aa4.78□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W HXT11P54862 567 aa4.78□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W ATG26Q06321 1198 aa4.78□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W DBP10Q12389 995 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
TIM54YJL054W SEC16P48415 2195 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W YAL064W-BO13512 126 aa4.77□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W RHO1P06780 209 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W YOL163WP0CF20 169 aa4.77□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W SAC1P32368 623 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W SLC1P33333 303 aa4.77□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W RSM22P36056 628 aa4.77□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W MAL32P38158 584 aa4.77□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W CIN4P39110 191 aa4.77□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W RFC4P40339 323 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W GPP1P41277 250 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W YNR068CP53754 272 aa4.77□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W MRPL19P53875 158 aa4.77□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W INN1P53901 409 aa4.77□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W MRPL1Q04599 285 aa4.77□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W VBA4Q04602 768 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W GTB1Q04924 702 aa4.77□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W FRE5Q08908 694 aa4.77□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W WTM1Q12363 437 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W PFK27Q12471 397 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W MHF2Q3E829 80 aa4.77□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W DET1Q99288 334 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W ATP2P00830 511 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W RAD7P06779 565 aa4.76□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W MSS18P08593 268 aa4.76□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W CMK2P22517 447 aa4.76□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W HSP30P25619 332 aa4.76□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W PEX3P28795 441 aa4.76□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W SNC1P31109 117 aa4.76□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W PRP19P32523 503 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W NUF2P33895 451 aa4.76□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W GPX1P36014 167 aa4.76□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W MTC6P38849 526 aa4.76□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W PEX18P38855 283 aa4.76□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W RCY1P39531 840 aa4.76□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W YEL068CP39977 110 aa4.76□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W MPM1P40364 252 aa4.76□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W GET1P53192 235 aa4.76□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W YGR126WP53274 230 aa4.76□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W RBG2P53295 368 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W GPI1P53306 609 aa4.76□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W SCS7Q03529 384 aa4.76□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W API2Q04413 109 aa4.76□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W RNH202Q05635 350 aa4.76□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W BCP1Q06338 283 aa4.76□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W SYO1Q07395 620 aa4.76□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W IRC19Q07843 230 aa4.76□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W CRT10Q08226 957 aa4.76□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data4.76□□□□□ -1.65not detected
TIM54YJL054W RLM1Q12224 676 aa4.76□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W MRX4Q12467 430 aa4.76□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W TFS1P14306 219 aa4.75□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W RER1P25560 188 aa4.75□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W ITR2P30606 609 aa4.75□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W ARP2P32381 391 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W CYS4P32582 507 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W TRS65P32893 560 aa4.75□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W ECM15P35195 104 aa4.75□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W RIB1P38066 345 aa4.75□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W SIC1P38634 284 aa4.75□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W YIL166CP40445 542 aa4.75□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W AVT7P40501 490 aa4.75□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W IMD4P50094 524 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W YGL235WP53071 178 aa4.75□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W SYF2P53277 215 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W DSL1P53847 754 aa4.75□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W TPS1Q00764 495 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W PEX12Q04370 399 aa4.75□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W SPC24Q04477 213 aa4.75□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W COQ11Q05892 277 aa4.75□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W YPR127WQ06494 345 aa4.75□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W GPI11Q06636 219 aa4.75□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W VPS36Q06696 566 aa4.75□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W BTS1Q12051 335 aa4.75□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W YDL180WQ12301 547 aa4.75□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W APC2Q12440 853 aa4.75□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W YOL087CQ99247 1116 aa4.75□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W PEP4P07267 405 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W PET9P18239 318 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W RPN2P32565 945 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W TIM12P32830 109 aa4.74□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W MDL1P33310 695 aa4.74□□□□□ -1.65
TIM54YJL054W MSN4P33749 630 aa4.74□□□□□ -1.65
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