RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4YDL105W VTI1Q04338 217 aa2.33□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W YLR297WQ05899 129 aa2.33□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W YPR195CQ06594 109 aa2.33□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W YLR012CQ07927 99 aa2.33□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W YPL245WQ12179 454 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W COX10P21592 462 aa2.32□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W PET18P25362 215 aa2.32□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W AST1P35183 429 aa2.32□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W RCK1P38622 512 aa2.32□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W SSO2P39926 295 aa2.32□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W INA22P40576 216 aa2.32□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W ZRG17P53735 605 aa2.32□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W CAB5Q03941 241 aa2.32□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W UBX2Q04228 584 aa2.32□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W STE23Q06010 1027 aa2.32□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W SAM4Q08985 325 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W DFM1Q12743 341 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W CPT1P17898 393 aa2.31□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W MRPL20P22354 195 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W ZRT1P32804 376 aa2.31□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W BUD2P33314 1104 aa2.31□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W YMR262WP38430 313 aa2.31□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W YHR035WP38769 630 aa2.31□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W POP2P39008 433 aa2.31□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W DSE1P40077 573 aa2.31□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W RRG9P40156 214 aa2.31□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W AIM20P40451 204 aa2.31□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W SLM1P40485 686 aa2.31□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W ASG7P46993 209 aa2.31□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W YGL118CP53132 145 aa2.31□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W VPS20Q04272 221 aa2.31□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W RTC5Q12108 567 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W YPR1Q12458 312 aa2.31□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W CUP2P15315 225 aa2.3□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W INO2P26798 304 aa2.3□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W PRY2P36110 329 aa2.3□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W SWC5P38326 303 aa2.3□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W YIL059CP40520 121 aa2.3□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W CAX4P53223 239 aa2.3□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W SMD1Q02260 146 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W YPL080CQ02826 108 aa2.3□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W SNX41Q04053 625 aa2.3□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W ECM19Q06011 112 aa2.3□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W MIM1Q08176 113 aa2.3□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W VIK1Q12045 647 aa2.3□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W REX3Q12090 404 aa2.3□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W UTP23Q12339 254 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W CBP2P03874 630 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W SUR1P33300 382 aa2.29□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W PET8P38921 284 aa2.29□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W YDR089WP38966 869 aa2.29□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W SOP4P39543 234 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W YFL040WP43562 540 aa2.29□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W OKP1P53298 406 aa2.29□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W YNR066CP53752 436 aa2.29□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W DIB1Q06819 143 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W TRM10Q12400 293 aa2.29□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W TFC7Q12415 435 aa2.29□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W GCD2P12754 651 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W MSS116P15424 664 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W SAR1P20606 190 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W YKL162CP36052 402 aa2.28□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W FET3P38993 636 aa2.28□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W PES4P39684 611 aa2.28□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W COS4P43542 379 aa2.28□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W CPR7P47103 393 aa2.28□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W YGR266WP53326 701 aa2.28□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W PRO2P54885 456 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W PBP4Q07362 185 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W PAA1Q12447 191 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W IZH4Q99393 312 aa2.28□□□□□ -2.04
NSE4YDL105W RPB9P27999 122 aa2.27□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W ASP1P38986 381 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W OSW5P40219 148 aa2.27□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W LOH1P47055 219 aa2.27□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W VOA1P53262 265 aa2.27□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W ABZ2Q03266 374 aa2.27□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W RFM1Q12192 310 aa2.27□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W LAG2Q92325 660 aa2.27□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data2.26□□□□□ -2.05not detected
NSE4YDL105W RAD7P06779 565 aa2.26□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W CAR2P07991 424 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W IFM1P25038 676 aa2.26□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W RPL16BP26785 198 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W IME2P32581 645 aa2.26□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W AGA2P32781 87 aa2.26□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W MRPL6P32904 214 aa2.26□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W CSE1P33307 960 aa2.26□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W MCH2P36032 473 aa2.26□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W AIM29P36154 155 aa2.26□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W EDC2P40023 145 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W COX16P47081 118 aa2.26□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W RIB4P50861 169 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W SWC4P53201 476 aa2.26□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W YOR292CQ08743 309 aa2.26□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W MDY2Q12285 212 aa2.26□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W ERP3Q12403 225 aa2.26□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W HPR1P17629 752 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
NSE4YDL105W RPL5P26321 297 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
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