RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562011.1

CTU2-203, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTU2, Length 324 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-203ENST00000562011 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 GBP3Q9H0R5 595 aa16.06■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 ADAM7Q9H2U9 754 aa16.06■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 IFT122Q9HBG6 1241 aa16.06■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 CHST12Q9NRB3 414 aa16.06■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 GJB4Q9NTQ9 266 aa16.06■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 FAM105AQ9NUU6 356 aa16.06■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 OFD1O75665 1012 aa16.05■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 DEXIO95424 95 aa16.05■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 BRD1O95696 1058 aa16.05■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 ASGR2P07307 311 aa16.05■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 GALTP07902 379 aa16.05■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 SLC11A1P49279 550 aa16.05■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 DNM2P50570 870 aa16.05■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 PTPN5P54829 565 aa16.05■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 TPRNQ4KMQ1 711 aa16.05■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 NOMO2Q5JPE7 1267 aa16.05■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 CATSPER4Q7RTX7 472 aa16.05■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 IGSF21Q96ID5 467 aa16.05■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 TRAIPQ9BWF2 469 aa16.05■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 MINDY3Q9H8M7 445 aa16.05■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 ARID2Q68CP9 1835 aa16.05■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 DENND4AQ7Z401 1863 aa16.04■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 CPLX1O14810 134 aa16.04■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 DDHD2O94830 711 aa16.04■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 REC8O95072 547 aa16.04■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 PSMC5P62195 406 aa16.04■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 ITIH3Q06033 890 aa16.04■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 LETM2Q2VYF4 491 aa16.04■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 CES5AQ6NT32 575 aa16.04■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 AGMOQ6ZNB7 445 aa16.04■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 ZNF410Q86VK4 478 aa16.04■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 SLC22A17Q8WUG5 538 aa16.04■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 TMEM143Q96AN5 459 aa16.04■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 C22orf23Q9BZE7 217 aa16.04■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 CYP26B1Q9NR63 512 aa16.04■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 VAV3Q9UKW4 847 aa16.04■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa16.04■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 C2orf16Q68DN1 1984 aa16.04■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 ZBTB39O15060 712 aa16.03■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 CTSAP10619 480 aa16.03■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 CDC42EP1Q00587 391 aa16.03■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 MOXD1Q6UVY6 613 aa16.03■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 GLB1LQ6UWU2 654 aa16.03■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 OXER1Q8TDS5 423 aa16.03■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 RIPOR3Q96MK2 946 aa16.03■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 KCNMB3Q9NPA1 279 aa16.03■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 NR2E1Q9Y466 385 aa16.03■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa16.03■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa16.03■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 PLXNA3P51805 1871 aa16.02■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 FAM205CA6NFA0 338 aa16.02■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 ZNF623O75123 536 aa16.02■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa16.02■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 PPP2R5CQ13362 524 aa16.02■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 UBXN11Q5T124 520 aa16.02■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 TMC5Q6UXY8 1006 aa16.02■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 KRT25Q7Z3Z0 450 aa16.02■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 HAS1Q92839 578 aa16.02■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 PHF20Q9BVI0 1012 aa16.02■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa16.02■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 RGL1Q9NZL6 768 aa16.02■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 LIMD1Q9UGP4 676 aa16.02■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 SORCS3Q9UPU3 1222 aa16.02■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 IRAK3Q9Y616 596 aa16.02■□□□□ 0.16
CTU2-203ENST00000562011 H0Y858 1186 aa16.01■□□□□ 0.15
CTU2-203ENST00000562011 MTHFRP42898 656 aa16.01■□□□□ 0.15
CTU2-203ENST00000562011 QARSP47897 775 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CTU2-203ENST00000562011 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CTU2-203ENST00000562011 SCRN1Q12765 414 aa16.01■□□□□ 0.15
CTU2-203ENST00000562011 PTPN14Q15678 1187 aa16.01■□□□□ 0.15
CTU2-203ENST00000562011 KIAA1841Q6NSI8 718 aa16.01■□□□□ 0.15
CTU2-203ENST00000562011 CEP170P1Q96L14 293 aa16.01■□□□□ 0.15
CTU2-203ENST00000562011 NECTIN4Q96NY8 510 aa16.01■□□□□ 0.15
CTU2-203ENST00000562011 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CTU2-203ENST00000562011 POMCP01189 267 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-203ENST00000562011 SKIP12755 728 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-203ENST00000562011 RAB27AP51159 221 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-203ENST00000562011 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-203ENST00000562011 MTMR3Q13615 1198 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-203ENST00000562011 GALNT17Q6IS24 598 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-203ENST00000562011 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CTU2-203ENST00000562011 NEK8Q86SG6 692 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-203ENST00000562011 POTEDQ86YR6 584 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-203ENST00000562011 TMEM105Q8N8V8 129 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-203ENST00000562011 TMEM87AQ8NBN3 555 aa16■□□□□ 0.15
CTU2-203ENST00000562011 DYDC2Q96IM9 177 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms