RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 KCT2Q8NC54 265 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 B3GNT4Q9C0J1 378 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 GALNT8Q9NY28 637 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 LUZP4Q9P127 313 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 FBXO40Q9UH90 709 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 LAMP5Q9UJQ1 280 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 FLT1P17948 1338 aa4.96□□□□□ -1.61
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIM43BA6NCK2 446 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM196BA6NMK8 535 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 IL33O95760 270 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 KRT14P02533 472 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 RAG1P15918 1043 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 PTPREP23469 700 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 MLH1P40692 756 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CASP2P42575 452 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 B2MP61769 119 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 PCNX4Q63HM2 1172 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SKA1Q96BD8 255 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SHISA4Q96DD7 197 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 AP1M1Q9BXS5 423 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 YIPF3Q9GZM5 350 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 KCTD10Q9H3F6 313 aa4.96□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 PALD1Q9ULE6 856 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF711Q9Y462 761 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 MROH7Q68CQ1 1323 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 EPN2O95208 641 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SYN1P17600 705 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 TNFAIP3P21580 790 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 GABREP78334 506 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 DR1Q01658 176 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CEP57Q86XR8 500 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC170Q8IYT3 715 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SIX5Q8N196 739 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 E2F7Q96AV8 911 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 C12orf42Q96LP6 360 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 FERD3LQ96RJ6 166 aa4.96□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 TINF2Q9BSI4 451 aa4.96□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 TACC3Q9Y6A5 838 aa4.96□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 PBXIP1Q96AQ6 731 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ARL8AQ96BM9 186 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 DBNDD2Q9BQY9 259 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 FOXP3Q9BZS1 431 aa4.96□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 WDR46O15213 610 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 ZW10O43264 779 aa4.95□□□□□ -1.62
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RABGGTB-213ENST00000496055 GNAT1P11488 350 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ZAP70P43403 619 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 GJA9P57773 515 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 RTP1P59025 263 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
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