RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493959.6

SENP6-211, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 867 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-211ENST00000493959 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa25.26■■□□□ 1.63
SENP6-211ENST00000493959 TCP11Q8WWU5 503 aa25.26■■□□□ 1.63
SENP6-211ENST00000493959 FAM105AQ9NUU6 356 aa25.26■■□□□ 1.63
SENP6-211ENST00000493959 ASAP2O43150 1006 aa25.25■■□□□ 1.63
SENP6-211ENST00000493959 OR52Z1P0C646 297 aa25.25■■□□□ 1.63
SENP6-211ENST00000493959 LAG3P18627 525 aa25.25■■□□□ 1.63
SENP6-211ENST00000493959 ADAM15Q13444 863 aa25.25■■□□□ 1.63
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SENP6-211ENST00000493959 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa25.25■■□□□ 1.63
SENP6-211ENST00000493959 PER2O15055 1255 aa25.24■■□□□ 1.63
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SENP6-211ENST00000493959 UBXN11Q5T124 520 aa25.24■■□□□ 1.63
SENP6-211ENST00000493959 MAEAQ7L5Y9 396 aa25.24■■□□□ 1.63
SENP6-211ENST00000493959 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa25.24■■□□□ 1.63
SENP6-211ENST00000493959 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa25.23■■□□□ 1.63
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SENP6-211ENST00000493959 LRRC43Q8N309 656 aa25.23■■□□□ 1.63
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SENP6-211ENST00000493959 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.632e-10■□□□□ 10.3
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SENP6-211ENST00000493959 TLE6Q9H808 572 aa25.22■■□□□ 1.63
SENP6-211ENST00000493959 TUFT1Q9NNX1 390 aa25.22■■□□□ 1.63
SENP6-211ENST00000493959 TLR9Q9NR96 1032 aa25.22■■□□□ 1.63
SENP6-211ENST00000493959 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa25.22■■□□□ 1.63
SENP6-211ENST00000493959 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa25.22■■□□□ 1.63
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SENP6-211ENST00000493959 CAPSQ13938 189 aa25.21■■□□□ 1.63
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SENP6-211ENST00000493959 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.21■■□□□ 1.63
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SENP6-211ENST00000493959 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
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SENP6-211ENST00000493959 NACC1Q96RE7 527 aa25.2■■□□□ 1.62
SENP6-211ENST00000493959 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SENP6-211ENST00000493959 EPHX3Q9H6B9 360 aa25.2■■□□□ 1.62
SENP6-211ENST00000493959 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SENP6-211ENST00000493959 POLD4Q9HCU8 107 aa25.2■■□□□ 1.62
SENP6-211ENST00000493959 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SENP6-211ENST00000493959 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa25.19■■□□□ 1.62
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SENP6-211ENST00000493959 TSPAN1O60635 241 aa25.19■■□□□ 1.62
SENP6-211ENST00000493959 GLP2RO95838 553 aa25.19■■□□□ 1.62
SENP6-211ENST00000493959 SKIP12755 728 aa25.19■■□□□ 1.62
SENP6-211ENST00000493959 RPA1P27694 616 aa25.19■■□□□ 1.62
SENP6-211ENST00000493959 PTGDRQ13258 359 aa25.19■■□□□ 1.62
SENP6-211ENST00000493959 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
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SENP6-211ENST00000493959 EFHBQ8N7U6 833 aa25.19■■□□□ 1.62
SENP6-211ENST00000493959 RNF39Q9H2S5 420 aa25.19■■□□□ 1.62
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SENP6-211ENST00000493959 GJB2P29033 226 aa25.18■■□□□ 1.62
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SENP6-211ENST00000493959 IL17AQ16552 155 aa25.18■■□□□ 1.62
SENP6-211ENST00000493959 AMHR2Q16671 573 aa25.18■■□□□ 1.62
SENP6-211ENST00000493959 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SENP6-211ENST00000493959 MCTP1Q6DN14 999 aa25.18■■□□□ 1.62
SENP6-211ENST00000493959 GLB1LQ6UWU2 654 aa25.18■■□□□ 1.62
SENP6-211ENST00000493959 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SENP6-211ENST00000493959 ZNF280BQ86YH2 543 aa25.18■■□□□ 1.62
SENP6-211ENST00000493959 VN1R2Q8NFZ6 395 aa25.18■■□□□ 1.62
SENP6-211ENST00000493959 PPP2R3CQ969Q6 453 aa25.18■■□□□ 1.62
SENP6-211ENST00000493959 TCF25Q9BQ70 676 aa25.18■■□□□ 1.62
SENP6-211ENST00000493959 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SENP6-211ENST00000493959 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SENP6-211ENST00000493959 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
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