RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482107.1

FNBP1-208, Transcript of formin binding protein 1, human

TSL 3

Gene FNBP1, Length 334 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FNBP1-208	ENST00000482107	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		4.93	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	HTT	P42858	3142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	PP2D1	A8MPX8	630 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	CA12	O43570	354 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	KLRC4	O43908	158 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	EYA4	O95677	639 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	AR	P10275	920 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	BMP6	P22004	513 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	ABCD1	P33897	745 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	ZNF76	P36508	570 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	CD97	P48960	835 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	ZNF165	P49910	485 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	SLC26A2	P50443	739 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	SLC12A3	P55017	1021 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	NKX3-2	P78367	333 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	PSMD2	Q13200	908 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	GRM1	Q13255	1194 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	NEDD9	Q14511	834 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	ECM1	Q16610	540 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	SPECC1	Q5M775	1068 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	METTL7B	Q6UX53	244 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	UNC13D	Q70J99	1090 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	SV2B	Q7L1I2	683 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	LRRC15	Q8TF66	581 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	MMP19	Q99542	508 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	KATNBL1	Q9H079	304 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	PORCN	Q9H237	461 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	UBE4B	O95155	1302 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	EMSY	Q7Z589	1322 aa		4.92	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	PLXNB2	O15031	1838 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107		A0A0A0MRY4	1105 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	EML1	O00423	815 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	MARCH6	O60337	910 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	MED24	O75448	989 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	LGR5	O75473	907 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	SLITRK3	O94933	977 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	CCNE2	O96020	404 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	PLA2G4B	P0C869	781 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	CYP2C8	P10632	490 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	ZNF18	P17022	549 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	GAP43	P17677	238 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	CYP11B2	P19099	503 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	CDC25A	P30304	524 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	MAP2K2	P36507	400 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	RTP1	P59025	263 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	PSMC5	P62195	406 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	MYL5	Q02045	173 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	PNOC	Q13519	176 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	CUL4B	Q13620	913 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	ALCAM	Q13740	583 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	NCAPH	Q15003	741 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	TLR1	Q15399	786 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	CAMK4	Q16566	473 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	NFIL3	Q16649	462 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		4.91	□□□□□ -1.62
FNBP1-208	ENST00000482107	KCNK18	Q7Z418	384 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms