RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRT79	Q5XKE5	535 aa		12.34	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		12.34	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	USP49	Q70CQ1	688 aa		12.34	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		12.34	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		12.34	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	DAW1	Q8N136	415 aa		12.34	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		12.34	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		12.34	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	CASD1	Q96PB1	797 aa		12.34	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	RAB34	Q9BZG1	259 aa		12.34	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	USP20	Q9Y2K6	914 aa		12.34	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		12.34	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	MYO7A	Q13402	2215 aa		12.34	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
GTPBP1-208	ENST00000475959	TCHH	Q07283	1943 aa		12.33	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A0U1RQF3	1178 aa		12.33	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		12.33	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959		H3BNC9	293 aa		12.33	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		12.33	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	GRM6	O15303	877 aa		12.33	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	B4GALT3	O60512	393 aa		12.33	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	EYA4	O95677	639 aa		12.33	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	GPM6B	Q13491	265 aa		12.33	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPECC1	Q5M775	1068 aa		12.33	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	CABP7	Q86V35	215 aa		12.33	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		12.33	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	CLIC6	Q96NY7	704 aa		12.33	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		12.33	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	CWH43	Q9H720	699 aa		12.33	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		12.33	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		12.33	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		12.33	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	ASAP2	O43150	1006 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	HIP1R	O75146	1068 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	ERLIN2	O94905	339 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	ITGB1	P05556	798 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	DNAJB1	P25685	340 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	BMPR1A	P36894	532 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	CDC42EP1	Q00587	391 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	CAMK1	Q14012	370 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	TFDP1	Q14186	410 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	12.32	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	SAMD11	Q96NU1	681 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	CSRNP2	Q9H175	543 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	CHST12	Q9NRB3	414 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	DACT1	Q9NYF0	836 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	HES2	Q9Y543	173 aa		12.32	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	BMP15	O95972	392 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLCG1	P19174	1290 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC12A3	P55017	1021 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	LRRC43	Q8N309	656 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	EPSTI1	Q96J88	318 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A087X0B3	334 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	F13A1	P00488	732 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	12.3	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRKCB	P05771	671 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	LIG1	P18858	919 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	IRS1	P35568	1242 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GTPBP1-208	ENST00000475959	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44

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