RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 LRRIQ4A6NIV6 560 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 C5orf67F2Z3F1 127 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 H3BNC9 293 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC26A4O43511 780 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 LPXNO60711 386 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 AXLP30530 894 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 BMPR1AP36894 532 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 UBA7P41226 1012 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 GATMP50440 423 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 GPM6BQ13491 265 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 PPP2R5AQ15172 486 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 PTPROQ16827 1216 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM117Q9H0C3 514 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 MINDY3Q9H8M7 445 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 GPRC5CQ9NQ84 441 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 EYSQ5T1H1 3165 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 E9PMD0 336 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 FGFR1P11362 822 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 LONP1P36776 959 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 HYIQ5T013 277 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 CABP7Q86V35 215 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 RSPH1Q8WYR4 309 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 KIFAP3Q92845 792 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 CALML4Q96GE6 196 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 IFT74Q96LB3 600 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 C2orf40Q9H1Z8 148 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 AAASQ9NRG9 546 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM105AQ9NUU6 356 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 BRWD1Q9NSI6 2320 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 VCANP13611 3396 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP1-205ENST00000466097 LINC00271P0C7V0 271 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 MBTD1Q05BQ5 628 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 NAALADL2Q58DX5 795 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 NOTUMQ6P988 496 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 LRRC43Q8N309 656 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 RASSF8Q8NHQ8 419 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 P2RX5Q93086 422 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 PGBD4Q96DM1 585 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC51Q96ER9 411 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 LMAN2LQ9H0V9 348 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 CLIC4Q9Y696 253 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 TSPAN1O60635 241 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF623O75123 536 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 NAMPTP43490 491 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM173BQ6P4H8 233 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 DEPTORQ8TB45 409 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 CASD1Q96PB1 797 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 TIPINQ9BVW5 301 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa16.32■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 TTC28Q96AY4 2481 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 LAG3P18627 525 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 PTPAQ15257 358 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM119Q4V9L6 283 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 TIGD5Q53EQ6 642 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 RINT1Q6NUQ1 792 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 GLB1LQ6UWU2 654 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 KCNK18Q7Z418 384 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 CNNM3Q8NE01 707 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 HELQQ8TDG4 1101 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 PRIMPOLQ96LW4 560 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 DRC1Q96MC2 740 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 PNMA5Q96PV4 448 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 PLIN2Q99541 437 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 RNF19AQ9NV58 838 aa16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 TXLNAP40222 546 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 EFNA5P52803 228 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 MAPK6Q16659 721 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM132AQ24JP5 1023 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 CLLU1OSQ5K130 101 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 HACE1Q8IYU2 909 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 BSNDQ8WZ55 320 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 CPB2Q96IY4 423 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP1-205ENST00000466097 USP28Q96RU2 1077 aa16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms