RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436447.5

AFG3L1P-211, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

TSL 5

Gene AFG3L1P, Length 3,003 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-211ENST00000436447 SOX10P56693 466 aa20.11■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 LLGL2Q6P1M3 1020 aa20.11■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 C1orf186Q6ZWK4 172 aa20.11■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 HES6Q96HZ4 224 aa20.11■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 FAM20AQ96MK3 541 aa20.11■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 ANKRD63C9JTQ0 380 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 SPOPO43791 374 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 CHRNA5P30532 468 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 C10orf76Q5T2E6 689 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 ZNF720Q7Z2F6 126 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 JAMLQ86YT9 394 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 SEC16BQ96JE7 1060 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 CRAMP1Q96RY5 1269 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 STK33Q9BYT3 514 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 ADAM33Q9BZ11 813 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 APEX2Q9UBZ4 518 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 CYP26A1O43174 497 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 ACSL3O95573 720 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 MMP10P09238 476 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 LMNB1P20700 586 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 PRKCIP41743 596 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 STAT2P52630 851 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 PPP3CAQ08209 521 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 TMEM179Q6ZVK1 233 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 PWWP2AQ96N64 755 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 PSMD1Q99460 953 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 NYAP2Q9P242 653 aa20.1■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 DNM1LO00429 736 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 ECE2O60344 883 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 CHN1P15882 459 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 Q4G0T1 1027 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 GRIPAP1Q4V328 841 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 ATP8B4Q8TF62 1192 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 C1orf54Q8WWF1 131 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 GPR88Q9GZN0 384 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 DLATP10515 647 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 COMTP21964 271 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 DENND2CQ68D51 928 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 HSD17B14Q9BPX1 270 aa20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 CCDC188H7C350 402 aa20.08■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 OSBPL7Q9BZF2 842 aa20.08■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa20.08■□□□□ 0.81
AFG3L1P-211ENST00000436447 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa20.08■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 SLC16A4O15374 487 aa20.08■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 PMS2P54278 862 aa20.08■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 MCTP2Q6DN12 878 aa20.08■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 SLC47A2Q86VL8 602 aa20.08■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 CD302Q8IX05 232 aa20.08■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa20.08■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa20.08■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 ANKRD42Q8N9B4 389 aa20.08■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 ATG4AQ8WYN0 398 aa20.08■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 AGPAT1Q99943 283 aa20.08■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 RGL2O15211 777 aa20.08■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 POLR2MP0CAP2 368 aa20.08■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 SSR1P43307 286 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 BFSP1Q12934 665 aa20.08■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 TTC27Q6P3X3 843 aa20.08■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 HHIPL2Q6UWX4 724 aa20.08■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 CRYGNQ8WXF5 182 aa20.08■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 AGBL1Q96MI9 1066 aa20.08■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 WDR11Q9BZH6 1224 aa20.08■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 GLT8D2Q9H1C3 349 aa20.08■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 TBK1Q9UHD2 729 aa20.08■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 CCDC169A6NNP5 214 aa20.07■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 MMEP08473 750 aa20.07■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 RPL21P46778 160 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 CDR1P51861 262 aa20.07■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 SETQ01105 290 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 SEPT14Q6ZU15 432 aa20.07■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 ERP44Q9BS26 406 aa20.07■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 PI4K2AQ9BTU6 479 aa20.07■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 TRAPPC3O43617 180 aa20.07■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 PYGMP11217 842 aa20.07■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 TNIP1Q15025 636 aa20.07■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 PADI6Q6TGC4 694 aa20.07■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 PRUNE1Q86TP1 453 aa20.07■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 TBC1D31Q96DN5 1066 aa20.07■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 TRIM7Q9C029 511 aa20.07■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 RAD17O75943 681 aa20.06■□□□□ 0.8
AFG3L1P-211ENST00000436447 FOSP01100 380 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms