RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TBKBP1A7MCY6 615 aa27.69■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa27.69■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TSPAN1O60635 241 aa27.69■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BMPR1AP36894 532 aa27.69■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UBXN11Q5T124 520 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RINT1Q6NUQ1 792 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C1orf186Q6ZWK4 172 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RNF169Q8NCN4 708 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CASD1Q96PB1 797 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NT5C3AQ9H0P0 336 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CSRNP2Q9H175 543 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HCSTQ9UBK5 93 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LRRIQ4A6NIV6 560 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 C5orf67F2Z3F1 127 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EOMESO95936 686 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CTNNB1P35222 781 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP27.67■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CLLU1OSQ5K130 101 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 USP49Q70CQ1 688 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DAW1Q8N136 415 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KCTD17Q8N5Z5 321 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM105AQ9NUU6 356 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 H3BNC9 293 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 B4GALT5O43286 388 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC26A4O43511 780 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UBA7P41226 1012 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC12A3P55017 1021 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC39A14Q15043 492 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPECC1Q5M775 1068 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPM1EQ8WY54 764 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LPPQ93052 612 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CPB2Q96IY4 423 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CLIC6Q96NY7 704 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM117Q9H0C3 514 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MEIS3P2A8K0S8 358 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF623O75123 536 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ERLIN2O94905 339 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NAMPTP43490 491 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NASPP49321 788 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MAPK7Q13164 816 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GPM6BQ13491 265 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KARSQ15046 597 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 LRRC55Q6ZSA7 311 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIFAP3Q92845 792 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EPSTI1Q96J88 318 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UNC80Q8N2C7 3258 aa27.64■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HOXA2O43364 376 aa27.64■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HIP1RO75146 1068 aa27.64■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 F13A1P00488 732 aa27.64■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RB1P06400 928 aa27.64■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLA2G4BP0C869 781 aa27.64■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIFC3Q9BVG8 833 aa27.64■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FZD8Q9H461 694 aa27.64■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CWH43Q9H720 699 aa27.64■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa27.64■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.01
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP27.63■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLCG1P19174 1290 aa27.63■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AXLP30530 894 aa27.63■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RAB27AP51159 221 aa27.63■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HELQQ8TDG4 1101 aa27.63■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CALML4Q96GE6 196 aa27.63■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCSER1Q9C0I3 900 aa27.63■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC113Q9H0I3 377 aa27.63■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LMCD1Q9NZU5 365 aa27.63■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa27.62■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NLRC5Q86WI3 1866 aa27.62■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TTLL13PA6NNM8 815 aa27.62■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SKIP12755 728 aa27.62■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GUCY2CP25092 1073 aa27.62■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa27.62■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LINC00301Q8NCQ3 95 aa27.62■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLVAPQ9BX97 442 aa27.62■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EDN1P05305 212 aa27.61■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PPP2R5AQ15172 486 aa27.61■■■□□ 2.01
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM187BQ17R55 369 aa27.61■■■□□ 2.01
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