RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 CBWD1Q9BRT8 395 aa21.94■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 SYT11Q9BT88 431 aa21.94■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 UBXN6Q9BZV1 441 aa21.94■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 OTOFQ9HC10 1997 aa21.94■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 SLC16A4O15374 487 aa21.94■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 RHOXF2BP0C7M4 288 aa21.94■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.94■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 PPATQ06203 517 aa21.94■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 EPC2Q52LR7 807 aa21.94■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 MEI1Q5TIA1 1274 aa21.94■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 USP37Q86T82 979 aa21.94■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 SULF1Q8IWU6 871 aa21.94■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 CAPZA3Q96KX2 299 aa21.94■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 FBXL18Q96ME1 805 aa21.94■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 RHOXF2Q9BQY4 288 aa21.94■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 GPR88Q9GZN0 384 aa21.94■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 GPRC5CQ9NQ84 441 aa21.94■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 GRID2IPA4D2P6 1211 aa21.93■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 IRF6O14896 467 aa21.93■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 PAFAH1B1P43034 410 aa21.93■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 IREB2P48200 963 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 VSNL1P62760 191 aa21.93■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 KIF22Q14807 665 aa21.93■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa21.93■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa21.93■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 KMT5AQ9NQR1 393 aa21.93■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 EMSYQ7Z589 1322 aa21.92■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF185O15231 689 aa21.92■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 BUB1O43683 1085 aa21.92■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 PALMO75781 387 aa21.92■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 H2AFZP0C0S5 128 aa21.92■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 EDNRBP24530 442 aa21.92■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 COPB2P35606 906 aa21.92■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 PLS1Q14651 629 aa21.92■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 MAP9Q49MG5 647 aa21.92■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 SWSAP1Q6NVH7 229 aa21.92■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 H2AFVQ71UI9 128 aa21.92■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 HDXQ7Z353 690 aa21.92■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 CYP26B1Q9NR63 512 aa21.92■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 L1RE1Q9UN81 338 aa21.92■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 TMEM150BA6NC51 233 aa21.92■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.11e-23■■■■□ 23.3
SUMO3-204ENST00000411651 CXCL11O14625 94 aa21.92■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 GTF2H1P32780 548 aa21.92■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 PLA2G4AP47712 749 aa21.92■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 PRKCEQ02156 737 aa21.92■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 GJB7Q6PEY0 223 aa21.92■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 TMC2Q8TDI7 906 aa21.92■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 COG1Q8WTW3 980 aa21.92■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 LMBR1Q8WVP7 490 aa21.92■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 SASH3O75995 380 aa21.91■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 GARTP22102 1010 aa21.91■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 CNGA1P29973 690 aa21.91■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 CFAP221Q4G0U5 840 aa21.91■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 C1orf220Q5T0J3 134 aa21.91■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 NFRKBQ6P4R8 1299 aa21.91■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 GPIHBP1Q8IV16 184 aa21.91■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 ANKRD35Q8N283 1001 aa21.91■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 SPATA4Q8NEY3 305 aa21.91■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 OLIG1Q8TAK6 271 aa21.91■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 PACSIN1Q9BY11 444 aa21.91■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 SPON1Q9HCB6 807 aa21.91■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 COQ4Q9Y3A0 265 aa21.91■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 PPME1Q9Y570 386 aa21.91■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa21.9■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 DENND3A2RUS2 1198 aa21.9■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC169A6NNP5 214 aa21.9■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 MXI1P50539 228 aa21.9■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 PPP3CAQ08209 521 aa21.9■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 TREML2Q5T2D2 321 aa21.9■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC181Q5TID7 509 aa21.9■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 IFT74Q96LB3 600 aa21.9■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 PCIF1Q9H4Z3 704 aa21.9■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa21.9■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 DDNO94850 711 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 ADSSP30520 456 aa21.9■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa21.9■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 ERO1BQ86YB8 467 aa21.9■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.9■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 ABCB6Q9NP58 842 aa21.9■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa21.9■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 NCANO14594 1321 aa21.89■■□□□ 1.1
SUMO3-204ENST00000411651 TGFB3P10600 412 aa21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms