RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409958.6

VSX1-204, Transcript of visual system homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VSX1, Length 1,305 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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VSX1-204ENST00000409958 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.94■■□□□ 1.26
VSX1-204ENST00000409958 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
VSX1-204ENST00000409958 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
VSX1-204ENST00000409958 SPTLC2O15270 562 aa22.93■■□□□ 1.26
VSX1-204ENST00000409958 PPP6R2O75170 966 aa22.93■■□□□ 1.26
VSX1-204ENST00000409958 EFNA5P52803 228 aa22.93■■□□□ 1.26
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