RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 CPT1AP50416 773 aa22.24■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 CCZ1BP86790 482 aa22.24■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 RBL2Q08999 1139 aa22.24■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 EFCAB12Q6NXP0 572 aa22.24■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.24■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 FAM186BQ8IYM0 893 aa22.24■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 LINC01465Q8N7H1 131 aa22.24■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 TC2NQ8N9U0 490 aa22.24■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 ANKRD63C9JTQ0 380 aa22.23■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 MAGEB2O15479 319 aa22.23■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 ADCY3O60266 1144 aa22.23■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 ADSSP30520 456 aa22.23■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.23■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 GOLGA8FQ08AF8 430 aa22.23■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa22.23■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.23■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 TRIM14Q14142 442 aa22.23■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 SYCP1Q15431 976 aa22.23■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 KAT2BQ92831 832 aa22.23■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 ZBTB10Q96DT7 871 aa22.23■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.23■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.23■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.23■■□□□ 1.15
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HDDC3-202ENST00000394272 IGBP1P78318 339 aa22.22■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.22■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 RETREG2Q8NC44 543 aa22.22■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.22■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.22■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 SRRDQ9UH36 339 aa22.22■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 SIK3Q9Y2K2 1263 aa22.22■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 HTTP42858 3142 aa22.22■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 GPR25O00155 361 aa22.22■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 EXOC3O60645 756 aa22.22■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 CLCN3P51790 818 aa22.22■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 KCNH2Q12809 1159 aa22.22■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 PPFIA1Q13136 1202 aa22.22■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 PCIF1Q9H4Z3 704 aa22.22■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 PYCARDQ9ULZ3 195 aa22.22■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.21■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 PIGRP01833 764 aa22.21■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 CASP14P31944 242 aa22.21■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 KLK7P49862 253 aa22.21■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 ADKP55263 362 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 TRIM32Q13049 653 aa22.21■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 GRIK4Q16099 956 aa22.21■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 METTL13Q8N6R0 699 aa22.21■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.21■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 SLC35C1Q96A29 364 aa22.21■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 TTYH3Q9C0H2 523 aa22.21■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 TMX1Q9H3N1 280 aa22.21■■□□□ 1.15
HDDC3-202ENST00000394272 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 K7ERI5 159 aa22.2■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 MFAP3LO75121 409 aa22.2■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 STRN3Q13033 797 aa22.2■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 MARCH8Q5T0T0 291 aa22.2■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 MTHFD1LQ6UB35 978 aa22.2■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.2■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 RNF149Q8NC42 400 aa22.2■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 HAS3O00219 553 aa22.2■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 MAPK13O15264 365 aa22.2■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 ASAP2O43150 1006 aa22.2■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 HOXD10P28358 340 aa22.2■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 EFNA5P52803 228 aa22.2■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 BEX3Q00994 111 aa22.2■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 FIGNQ5HY92 759 aa22.2■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.2■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 CPLX3Q8WVH0 158 aa22.2■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 NUP58Q9BVL2 599 aa22.2■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.2■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 SEPT4O43236 478 aa22.19■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 AFPP02771 609 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 EDN1P05305 212 aa22.19■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 GJB1P08034 283 aa22.19■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 SKILP12757 684 aa22.19■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 GARTP22102 1010 aa22.19■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 GJA9P57773 515 aa22.19■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 KCNMA1Q12791 1236 aa22.19■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.19■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 CNGA4Q8IV77 575 aa22.19■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa22.19■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.19■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.18■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.18■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 ELNP15502 786 aa22.18■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 MFSD10Q14728 455 aa22.18■■□□□ 1.14
HDDC3-202ENST00000394272 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
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