RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 SMOC2Q9H3U7 446 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 KCNJ14Q9UNX9 436 aa21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 PRR23AA6NEV1 266 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 NPY5RQ15761 445 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 KRT25Q7Z3Z0 450 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 CHST12Q9NRB3 414 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 IRAK3Q9Y616 596 aa21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 M0R2N6 131 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF862O60290 1169 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 FGFR4P22455 802 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 RBM25P49756 843 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 CDC42EP1Q00587 391 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZBP1Q9H171 429 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 DISC1Q9NRI5 854 aa21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 DTNBO60941 627 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.044e-14■□□□□ 9.5
TRAPPC3-204ENST00000373166 CTSAP10619 480 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 PRKCEQ02156 737 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 KANK3Q6NY19 840 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 CABP7Q86V35 215 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 AUTS2Q8WXX7 1259 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 CYP26B1Q9NR63 512 aa21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC3-204ENST00000373166 SKIP12755 728 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 EPCAMP16422 314 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 PHKA2P46019 1235 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 PPFIBP1Q86W92 1011 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC22A17Q8WUG5 538 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 LENG9Q96B70 501 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 IGSF21Q96ID5 467 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 KIF2CQ99661 725 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRAIPQ9BWF2 469 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 BRMS1Q9HCU9 246 aa21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 EVPLQ92817 2033 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 SFNP31947 248 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRIM29Q14134 588 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 GLB1LQ6UWU2 654 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMC5Q6UXY8 1006 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 FRMD5Q7Z6J6 570 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 FLCNQ8NFG4 579 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 RIT2Q99578 217 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 SPDYE4A6NLX3 237 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 MSH4O15457 936 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 JAK2O60674 1132 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 TDP2O95551 362 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 DNM2P50570 870 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 JAK3P52333 1124 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 INF2Q27J81 1249 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 Q4G0T1 1027 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 MOXD1Q6UVY6 613 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 OTOP3Q7RTS5 596 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 SFXN1Q9H9B4 322 aa21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 VPS13AQ96RL7 3174 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 CHMP2AO43633 222 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 GAS7O60861 476 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 GALTP07902 379 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 KRT2P35908 639 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 ST3GAL1Q11201 340 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 RABEP1Q15276 862 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 UGCGQ16739 394 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 NOMO2Q5JPE7 1267 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC149Q6ZUS6 474 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPR149Q86SP6 731 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 TEKT3Q9BXF9 490 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 TBC1D13Q9NVG8 400 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 STK39Q9UEW8 545 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 A0A087WZ62 844 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 EDIL3O43854 480 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 CYP3A7P24462 503 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 DRP2Q13474 957 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 TDGQ13569 410 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 LETM2Q2VYF4 491 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 LONRF3Q496Y0 759 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 LRCH2Q5VUJ6 765 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC3-204ENST00000373166 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa21.47■■□□□ 1.03
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