RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 EPHB1P54762 984 aa22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 POLE2P56282 527 aa22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 RHOT1Q8IXI2 618 aa22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 UBN1Q9NPG3 1134 aa22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 SLC4A1P02730 911 aa22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 PDIA5Q14554 519 aa22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 MARK3P27448 753 aa22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 FOXO4P98177 505 aa22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 TTC39CQ8N584 583 aa22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC37BQ96QE4 947 aa22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GTH6 734 aa22.53■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 HAUS5O94927 633 aa22.53■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 SUN2Q9UH99 717 aa22.53■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.53■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.53■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 PASD1Q8IV76 773 aa22.53■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 CHMP6Q96FZ7 201 aa22.53■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 PHKA2P46019 1235 aa22.53■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 CACNB3P54284 484 aa22.53■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.53■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.53■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 CIITAP33076 1130 aa22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA1841Q6NSI8 718 aa22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 SYNE4Q8N205 404 aa22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 SNF8Q96H20 258 aa22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 WDR24Q96S15 920 aa22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 COL15A1P39059 1388 aa22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD65E5RJM6 399 aa22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 PDXKO00764 312 aa22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 TDP2O95551 362 aa22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 SPDYE6P0CI01 402 aa22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 PYGBP11216 843 aa22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 SOX5P35711 763 aa22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 ACAD11Q709F0 780 aa22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 TTLL6Q8N841 843 aa22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 SDC4P31431 198 aa22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 TRIML2Q8N7C3 387 aa22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 GRAMD1AQ96CP6 724 aa22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 CYTH2Q99418 400 aa22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 KRT82Q9NSB4 513 aa22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 SNX12Q9UMY4 172 aa22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-201ENST00000284617 F5H6K3 240 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 KLRC3Q07444 240 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 ITIH6Q6UXX5 1313 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 PSMC5P62195 406 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 ICE2Q659A1 982 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 PNMA3Q9UL41 463 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 PPME1Q9Y570 386 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 MMP10P09238 476 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 ZBTB17Q13105 803 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGEF6Q15052 776 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 ATP11CQ8NB49 1132 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM9Q9C026 710 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 HEY1Q9Y5J3 304 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 GNA15P30679 374 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 MTRQ99707 1265 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 CFAP73A6NFT4 308 aa22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 FCER1AP12319 257 aa22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 GPC3P51654 580 aa22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 VIPAS39Q9H9C1 493 aa22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 FOXP2O15409 715 aa22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 SMARCA1P28370 1054 aa22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 EPC1Q9H2F5 836 aa22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM33Q9UPN9 1127 aa22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms