RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258243.6

URB2-201, Transcript of URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene URB2, Length 5,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URB2-201ENST00000258243 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa11.65□□□□□ -0.54
URB2-201ENST00000258243 BBOF1Q8ND07 529 aa11.65□□□□□ -0.54
URB2-201ENST00000258243 CENPKQ9BS16 269 aa11.65□□□□□ -0.54
URB2-201ENST00000258243 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa11.65□□□□□ -0.54
URB2-201ENST00000258243 GGPS1O95749 300 aa11.65□□□□□ -0.54
URB2-201ENST00000258243 S100BP04271 92 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
URB2-201ENST00000258243 EPHB4P54760 987 aa11.65□□□□□ -0.54
URB2-201ENST00000258243 E2F5Q15329 346 aa11.65□□□□□ -0.54
URB2-201ENST00000258243 UNC13DQ70J99 1090 aa11.65□□□□□ -0.54
URB2-201ENST00000258243 NDUFAF2Q8N183 169 aa11.65□□□□□ -0.54
URB2-201ENST00000258243 PGBD4Q96DM1 585 aa11.65□□□□□ -0.54
URB2-201ENST00000258243 RPSAP08865 295 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 ZNF543Q08ER8 600 aa11.65□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 PDZD8Q8NEN9 1154 aa11.65□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 PARD3BQ8TEW8 1205 aa11.65□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 SDCCAG3Q96C92 435 aa11.65□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 SAAL1Q96ER3 474 aa11.65□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 DPH5Q9H2P9 285 aa11.65□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 STX2P32856 288 aa11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 PTPROQ16827 1216 aa11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 YAF2Q8IY57 180 aa11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 RUNDC3BQ96NL0 473 aa11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 CPT1AP50416 773 aa11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 CDR2Q01850 454 aa11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 EPHA7Q15375 998 aa11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 IER5Q5VY09 327 aa11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 SFR1Q86XK3 245 aa11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 OPTNQ96CV9 577 aa11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 GFPT2O94808 682 aa11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 RHOBTB1O94844 696 aa11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 SLC4A1P02730 911 aa11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 KRT3P12035 628 aa11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 ATF2P15336 505 aa11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 GARSP41250 739 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 EPHB1P54762 984 aa11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 VEPH1Q14D04 833 aa11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 HOMER3Q9NSC5 361 aa11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 DONSONQ9NYP3 566 aa11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 KLHL14Q9P2G3 628 aa11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 KRT1P04264 644 aa11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 CPB1P15086 417 aa11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 CYFIP1Q7L576 1253 aa11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 KCTD6Q8NC69 237 aa11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 FAM213AQ9BRX8 229 aa11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 SPZ1Q9BXG8 430 aa11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 USP32Q8NFA0 1604 aa11.64□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 F8W8V4 182 aa11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 C2orf54Q08AI8 447 aa11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 CEP55Q53EZ4 464 aa11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 XXYLT1Q8NBI6 393 aa11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 NRBF2Q96F24 287 aa11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 TRIM8Q9BZR9 551 aa11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 UBAP1Q9NZ09 502 aa11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 EFNA5P52803 228 aa11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 ERICH1Q86X53 443 aa11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 PXDNLA1KZ92 1463 aa11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 SKIP12755 728 aa11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 ACTN1P12814 892 aa11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 ERO1BQ86YB8 467 aa11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 CDKL2Q92772 493 aa11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 POTECB2RU33 542 aa11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 BNIP3LO60238 219 aa11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 SRGNP10124 158 aa11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 TADA2BQ86TJ2 420 aa11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 STAG2Q8N3U4 1231 aa11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 KCNF1Q9H3M0 494 aa11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 SEL1LQ9UBV2 794 aa11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 MCF2LO15068 1137 aa11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 TRAPPC3O43617 180 aa11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 SLC10A5Q5PT55 438 aa11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 SEPT1Q8WYJ6 367 aa11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 SCYL1Q96KG9 808 aa11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 ZNF560Q96MR9 790 aa11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 UBN1Q9NPG3 1134 aa11.63□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 ARHGAP42A6NI28 874 aa11.62□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 SGK1O00141 431 aa11.62□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 ALDH1A1P00352 501 aa11.62□□□□□ -0.55
URB2-201ENST00000258243 CTSHP09668 335 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms