RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000194810.5

Vamp4-208, Transcript of Vesicle-associated membrane protein 4, mouse

TSL 5 BASIC

Gene Vamp4, Length 600 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Elavl1	P70372	326 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
Vamp4-208	ENSMUST00000194810		Q3TEI4	1023 aa		4.09	□□□□□ -1.75
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Trappc9	Q3U0M1	1148 aa		4.09	□□□□□ -1.75
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Cmpk2	Q3U5Q7	447 aa		4.09	□□□□□ -1.75
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Sfmbt2	Q5DTW2	938 aa		4.09	□□□□□ -1.75
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Frmd5	Q6P5H6	517 aa		4.09	□□□□□ -1.75
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Pik3c3	Q6PF93	887 aa		4.09	□□□□□ -1.75
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Polrmt	Q8BKF1	1207 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Mcat	Q8R3F5	381 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Mfsd6l	Q8R3N2	586 aa		4.09	□□□□□ -1.75
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Mgat5	Q8R4G6	740 aa		4.09	□□□□□ -1.75
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Ttll1	Q91V51	423 aa		4.09	□□□□□ -1.75
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Mrgprb5	Q91ZB9	322 aa		4.09	□□□□□ -1.75
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Sp5	Q9JHX2	398 aa		4.09	□□□□□ -1.75
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Tgm1	Q9JLF6	815 aa		4.09	□□□□□ -1.75
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Thsd1	Q9JM61	851 aa		4.09	□□□□□ -1.75
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Igkv6-20	A0A140T8P2	115 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Gm8994	E9PV04	411 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Colca2	F8VPY8	239 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Chrna4	O70174	629 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Il4r	P16382	810 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Kcnj5	P48545	419 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Cdkn1c	P49919	348 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Folr2	Q05685	251 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Ddx4	Q61496	702 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Fscn1	Q61553	493 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Tbata	Q7TSD4	393 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Llgl1	Q80Y17	1036 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Tmem74	Q8BQU7	305 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Lypd4	Q8BVP6	246 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Parp10	Q8CIE4	960 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Ipo13	Q8K0C1	963 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Scara5	Q8K299	491 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Sirt3	Q8R104	334 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Stac2	Q8R1B0	408 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Rev1	Q920Q2	1249 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Lysmd3	Q99LE3	305 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Ino80b	Q99PT3	375 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Trmt11	Q9CWH5	460 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Tstd3	Q9D0B5	157 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Phtf1	Q9QZ09	761 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Col13a1	Q9R1N9	751 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Ncdn	Q9Z0E0	729 aa		4.08	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Fam81b	A0A140LI28	432 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Fscb	A1EGX6	1074 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Gm6268	A2A3U9	297 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Prr32	A2AFE9	284 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Btn2a2	A4QPC6	514 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Izumo3	A6PWV3	263 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Sgo2b	J3QMK1	1167 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Gm3591	K7N6X2	186 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Mdm4	O35618	489 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Got1	P05201	413 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Gsx1	P31315	261 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Igfbp6	P47880	238 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Mybl2	P48972	704 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Gnat2	P50149	354 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Dnajc30	P59041	219 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Cyp2e1	Q05421	493 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Olfr125	Q14AJ9	320 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Rhox3a	Q4TU90	215 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Papola	Q61183	739 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Rnf220	Q6PDX6	566 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Mgat5b	Q765H6	792 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Cpeb4	Q7TN98	729 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Bank1	Q80VH0	783 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Ggn	Q80WJ1	673 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Ccdc150	Q8CDI7	1110 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Gm5591	Q8CDK1	855 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Polr3e	Q9CZT4	710 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Rabl3	Q9D4V7	236 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Ppp1r12a	Q9DBR7	1029 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Dkk2	Q9QYZ8	259 aa		4.07	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Meioc	A2AG06	965 aa		4.06	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	BC049352	E9Q2Z6	85 aa		4.06	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	St8sia2	O35696	375 aa		4.06	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Enam	O55196	1274 aa		4.06	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Gstm3	P19639	218 aa		4.06	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Cbx2	P30658	519 aa		4.06	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Itgav	P43406	1044 aa		4.06	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Inpp5j	P59644	1003 aa		4.06	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Arvcf	P98203	962 aa		4.06	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Rnf44	Q3UHJ8	407 aa		4.06	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Mocs1	Q5RKZ7	636 aa		4.06	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Cp	Q61147	1061 aa		4.06	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Ddx55	Q6ZPL9	600 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Elac2	Q80Y81	831 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Bola3	Q8CEI1	110 aa		4.06	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Saysd1	Q8K190	188 aa		4.06	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Pcdhb4	Q91XZ6	784 aa		4.06	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Mogat1	Q91ZV4	335 aa		4.06	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Camk2g	Q923T9	529 aa		4.06	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Cenpp	Q9CZ92	286 aa		4.06	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Mdm1	Q9D067	708 aa		4.06	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Hip1r	Q9JKY5	1068 aa		4.06	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Irx4	Q9QY61	515 aa		4.06	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Clcnkb	Q9WUB6	687 aa		4.06	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Gria3	Q9Z2W9	888 aa		4.06	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Gm4779	A0A1B0GR91	561 aa		4.05	□□□□□ -1.76
Vamp4-208	ENSMUST00000194810	Rhox3f	A2ANE1	215 aa		4.05	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.3 ms