RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000057254.5

Ubqln3-201, Transcript of Ubiquilin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubqln3, Length 2,376 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 VegfaQ00731 214 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Kmt5aQ2YDW7 349 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Skap2Q3UND0 358 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Capn13Q3UW68 665 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Wdr18Q4VBE8 431 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Zcchc2Q69ZB8 1166 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ncapg2Q6DFV1 1138 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ppp2r5aQ6PD03 486 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Leg1Q8C6C9 337 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Cbwd1Q8VEH6 393 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ube2sQ921J4 223 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Med15Q924H2 789 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Rnf34Q99KR6 376 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Emc2Q9CRD2 297 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Cfap53Q9D439 514 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Stk32bQ9JJX8 414 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Abcb11Q9QY30 1321 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Mroh9G5E8L9 891 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Vmn2r15L7N2A0 855 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Calb1P12658 261 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Nap1l1P28656 391 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ighmbp2P40694 993 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Pik3caP42337 1068 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Senp1P59110 640 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Irx2P81066 474 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Trim43aQ3TL54 445 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Erich4Q3UNU4 136 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Spdye4aQ5IBH6 268 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Rgl2Q61193 778 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Recql4Q75NR7 1216 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Tubb2aQ7TMM9 445 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ints8Q80V86 995 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ccdc169Q8BXX9 214 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 IrgqQ8VIM9 583 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ces1fQ91WU0 561 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ubxn2aQ99KJ0 258 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Tubb2bQ9CWF2 445 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Grtp1Q9D3N8 359 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Slc15a2Q9ES07 729 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Rnf103Q9R1W3 683 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Fzd9Q9R216 592 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Pacsin2Q9WVE8 486 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Atp2c2A7L9Z8 944 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Sclt1G5E861 688 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Fmr1P35922 614 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Hmgcs2P54869 508 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 rp9P97762 213 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Cdr2P97817 455 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Nhej1Q3KNJ2 295 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Trip13Q3UA06 432 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Oog4Q4G0C7 502 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 NrcamQ810U4 1256 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ireb2Q811J3 963 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Osbpl2Q8BX94 484 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Dhx32Q8BZS9 744 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Fbxo43Q8CDI2 640 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Vmn1r218Q8R261 298 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Chn1Q91V57 459 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ubxn1Q922Y1 297 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Prc1Q99K43 603 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Tas1r1Q99PG6 842 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Cpne8Q9DC53 577 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Uchl3Q9JKB1 230 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 FlgP11088 336 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Frmd8Q3UFK8 466 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Gm10392Q3V3I3 114 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 MmeQ61391 750 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Senp5Q6NXL6 749 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Supt20hQ7TT00 530 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 LarsQ8BMJ2 1178 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Fam193aQ8CGI1 1231 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ulbp1Q8HWA3 334 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Unc5bQ8K1S3 945 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Atp2a1Q8R429 994 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Mageb16Q9CWV4 363 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Bcs1lQ9CZP5 418 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Acsl3Q9CZW4 720 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Syf2Q9D198 242 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Stk4Q9JI11 487 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Olig1Q9JKN5 260 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Tjp2Q9Z0U1 1167 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Clca3bE9PUL3 1044 aa9.58□□□□□ -0.88
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Gm1758F6VZZ1 202 aa9.58□□□□□ -0.88
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Pja1O55176 578 aa9.58□□□□□ -0.88
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 MafbP54841 323 aa9.58□□□□□ -0.88
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 AdkP55264 361 aa9.58□□□□□ -0.88
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 ItgadQ3V0T4 1168 aa9.58□□□□□ -0.88
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Abhd15Q5F2F2 459 aa9.58□□□□□ -0.88
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 A1cfQ5YD48 595 aa9.58□□□□□ -0.88
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Lrig3Q6P1C6 1117 aa9.58□□□□□ -0.88
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Mapk15Q80Y86 549 aa9.58□□□□□ -0.88
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ankfy1Q810B6 1169 aa9.58□□□□□ -0.88
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Mia3Q8BI84 1930 aa9.58□□□□□ -0.88
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ttc16Q8C1F5 767 aa9.58□□□□□ -0.88
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Q8C1R3 189 aa9.58□□□□□ -0.88
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 PdgfcQ8CI19 345 aa9.58□□□□□ -0.88
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ero1bQ8R2E9 467 aa9.58□□□□□ -0.88
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Usp15Q8R5H1 981 aa9.58□□□□□ -0.88
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Pcdhgb4Q91XX6 912 aa9.58□□□□□ -0.88
Ubqln3-201ENSMUST00000057254 Ergic2Q9CR89 377 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.5 ms