RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sucla2Q9Z2I9 463 aa13.71□□□□□ -0.21
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rassf2Q8BMS9 326 aa13.7□□□□□ -0.22
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arl2bpQ9D385 163 aa13.7□□□□□ -0.22
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgef10lA2AWP8 1280 aa13.69□□□□□ -0.22
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trim32Q8CH72 655 aa13.69□□□□□ -0.22
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rexo2Q9D8S4 237 aa13.69□□□□□ -0.22
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Calr3Q9D9Q6 380 aa13.69□□□□□ -0.22
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GgcxQ9QYC7 757 aa13.69□□□□□ -0.22
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcnh2O35219 1162 aa13.68□□□□□ -0.22
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp11b2P15539 500 aa13.68□□□□□ -0.22
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mettl13Q91YR5 698 aa13.68□□□□□ -0.22
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Celf2Q9Z0H4 508 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ap1b1O35643 943 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cxcl9P18340 126 aa13.68□□□□□ -0.22
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ctnnd1P30999 938 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc33Q3ULW6 985 aa13.68□□□□□ -0.22
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Xpnpep1Q6P1B1 623 aa13.68□□□□□ -0.22
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bola2Q8BGS2 86 aa13.68□□□□□ -0.22
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pak2Q8CIN4 524 aa13.68□□□□□ -0.22
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnajc28Q8VCE1 385 aa13.68□□□□□ -0.22
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MyocdQ8VIM5 935 aa13.68□□□□□ -0.22
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NptxrQ99J85 493 aa13.68□□□□□ -0.22
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smtnl1Q99LM3 459 aa13.68□□□□□ -0.22
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mipol1Q9D9F8 279 aa13.68□□□□□ -0.22
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Celf5D3Z4T1 395 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
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