RNA–Protein interactions for RNA: YNL108C

YNL108C, Transcript of Protein phosphatase, yeast

Gene YNL108C, Length 813 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL108C	YNL108C	YAT2	P40017	923 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YNL108C	YNL108C	PHM8	P40025	321 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YNL108C	YNL108C	LAS21	P40367	830 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YNL108C	YNL108C	COA1	P40452	197 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YNL108C	YNL108C	YPS6	P40583	537 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YNL108C	YNL108C	TAD2	P47058	250 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YNL108C	YNL108C	BRR6	P53062	197 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YNL108C	YNL108C	BIO4	P53630	237 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YNL108C	YNL108C	SAE3	P89114	91 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YNL108C	YNL108C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
YNL108C	YNL108C	SWF1	Q04629	336 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YNL108C	YNL108C	YNG1	Q08465	219 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YNL108C	YNL108C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
YNL108C	YNL108C	TRM13	Q12383	476 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YNL108C	YNL108C	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YNL108C	YNL108C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	INM1	P38710	295 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	GPI16	P38875	610 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	5.21	□□□□□ -1.58	not detected
YNL108C	YNL108C	BMT5	P40493	336 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	GDS1	P41913	522 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	TDA10	P42938	290 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	SHY1	P53266	389 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	GTR2	P53290	341 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	MKC7	P53379	596 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.21	□□□□□ -1.58	not detected
YNL108C	YNL108C	YPL077C	Q02831	240 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	NRG1	Q03125	231 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	YDR209C	Q03480	137 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	PLP1	Q04004	230 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	STP3	Q05937	343 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	ARR3	Q06598	404 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	ASR1	Q06834	288 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	ENB1	Q08299	606 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	FRE7	Q12333	620 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	ERP3	Q12403	225 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	RDI1	Q12434	202 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	ZPS1	Q12512	249 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		5.21	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	SNF3	P10870	884 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	SEC22	P22214	214 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	FUB1	P25659	250 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	GAC1	P28006	793 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	FUN26	P31381	517 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	RGT1	P32862	1170 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	ELF1	P36053	145 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	PHO90	P39535	881 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	ELO1	P39540	310 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	FMP52	P40008	231 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	PAC10	P48363	199 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	YGR017W	P53210	297 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	YPL080C	Q02826	108 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	GIP3	Q03016	1276 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	MHR1	Q06630	226 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	SLO1	Q3E784	85 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	COX3	P00420	269 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.19	□□□□□ -1.58	not detected
YNL108C	YNL108C	EHD3	P28817	500 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	JEN1	P36035	616 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	RCK2	P38623	610 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	WSC4	P38739	605 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	UBA4	P38820	440 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	SHO1	P40073	367 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	SYG1	P40528	902 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	NIF3	P53081	288 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	NRK1	P53915	240 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	AAT1	Q01802	451 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	NUP53	Q03790	475 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	YMR087W	Q04299	284 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	NKP2	Q06162	153 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	HNT3	Q08702	217 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	NCA2	Q12374	616 aa		5.19	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	COR1	P07256	457 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	AMD2	P22580	549 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	IFM1	P25038	676 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	HES1	P35843	434 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	APL3	P38065	1025 aa		5.18	□□□□□ -1.58
YNL108C	YNL108C	MBB1	P39534	108 aa		5.18	□□□□□ -1.58

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 42.8 ms