RNA–Protein interactions for RNA: YLR073C

RFU1, Transcript of Protein that inhibits Doa4p deubiquitinating activity, yeast

Gene RFU1, Length 603 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RFU1	YLR073C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	LDB16	P25587	256 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	YOX1	P34161	385 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	VHC1	P38329	1120 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	YHL012W	P38709	493 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	BIG1	P38813	335 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	ECM1	P39715	212 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	RPH1	P39956	796 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	COX15	P40086	486 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	PHO86	P46956	311 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	IKS1	P47042	667 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	IMO32	P53219	342 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	YGR079W	P53249	370 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	MPS1	P54199	764 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	IZH1	Q03419	316 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	YMR160W	Q03823	816 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	FAR8	Q05040	523 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	RUP1	Q12242	671 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	APL1	P27351	700 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	SIN4	P32259	974 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	SPO23	P33757	523 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	SKT5	P34226	696 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	COS9	P36034	407 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	DTR1	P38125	572 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	CHK1	P38147	527 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	MIC12	P38341	106 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	SIC1	P38634	284 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	FET3	P38993	636 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	MSS4	P38994	779 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	ICE2	P40499	491 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	PHB1	P40961	287 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	AGP3	P43548	558 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	YJR149W	P47177	404 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	PLB2	Q03674	706 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	SIZ1	Q04195	904 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	SPC24	Q04477	213 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	COQ11	Q05892	277 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	AIM39	Q08223	395 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	AAD15	Q08361	143 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	AFT2	Q08957	416 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	BAG7	Q12128	409 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	RMD5	Q12508	421 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	GIT1	P25346	518 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	YCR006C	P25350	157 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	CTR86	P25355	563 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	PTC6	P25646	442 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	HIS2	P38635	335 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	YHR112C	P38716	378 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	YHR122W	P38829	231 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	SRP14	P38985	146 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	CIN4	P39110	191 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	SEO1	P39709	593 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	YER184C	P39961	794 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	YJL163C	P46996	555 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	BIR1	P47134	954 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	YGL204C	P53089	101 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	YGL108C	P53139	140 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	PEX31	P53203	462 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	ASI2	P53895	289 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	CDC123	Q05791	360 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	DIC1	Q06143	298 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	POS5	Q06892	414 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	YET3	Q07451	203 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	CYK3	Q07533	885 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	YOL024W	Q08172	172 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	YAP7	Q08182	245 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	ESA1	Q08649	445 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	TMS1	Q12116	473 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	MSH5	Q12175	901 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	STT4	P37297	1900 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	YLR415C	O13578	112 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	BI2	P03873	423 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	YCL042W	P25572	119 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	MSK1	P32048	576 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	RRN10	P38204	145 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	QDR3	P38227	689 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	APD1	P38281	316 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	PTC7	P38797	343 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	GPI16	P38875	610 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RFU1	YLR073C	TIM17	P39515	158 aa		4.16	□□□□□ -1.74

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