RNA–Protein interactions for RNA: YFR021W

ATG18, Transcript of Phosphoinositide binding protein, yeast

Gene ATG18, Length 1,503 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG18	YFR021W	TDA11	P38854	504 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	YND1	P40009	630 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	DFG10	P40526	253 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	YIL029C	P40538	142 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	PMT4	P46971	762 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	LCB3	P47013	409 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	KTR6	P54070	446 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	ASR1	Q06834	288 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	YLR012C	Q07927	99 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	DDC1	Q08949	612 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	EAF3	Q12432	401 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	IZH4	Q99393	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	SAL1	D6W196	494 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	PTP1	P25044	335 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	NUP2	P32499	720 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	SPO23	P33757	523 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	RPC37	P36121	282 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	AIM29	P36154	155 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	RPH1	P39956	796 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	YNL320W	P42840	284 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	TIS11	P47977	285 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	HCH1	P53834	153 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	TDA1	Q03533	586 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	SLM3	Q12093	417 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	RPN6	Q12377	434 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	YOS9	Q99220	542 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	RAD51	P25454	400 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	MRPL50	P53724	139 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
ATG18	YFR021W	OST6	Q03723	332 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	MSH5	Q12175	901 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	REP1	P03871	373 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	CYC3	P06182	269 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	YCR043C	P25361	127 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	YKL063C	P35725	167 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	LDB7	P38210	180 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	ECM8	P38246	354 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	RCK2	P38623	610 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	MET30	P39014	640 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	CIN2	P46670	268 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	TRM82	Q03774	444 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	SNX41	Q04053	625 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	VBA1	Q04301	562 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	SMC5	Q08204	1093 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	POM33	Q12164	279 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	FUN26	P31381	517 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	CAB3	P36076	571 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	GDS1	P41913	522 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	NCA3	P46955	337 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	COS10	P52924	374 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	MST27	P53176	234 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	YDL114W	Q07530	308 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	DAP1	Q12091	152 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	TRP1	P00912	224 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	DDI1	P40087	428 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	SWC4	P53201	476 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	WSC2	P53832	503 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	GRS2	Q06817	618 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	YOR387C	Q08910	206 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	FCY22	Q12119	530 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	FRE8	Q12209	686 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	HEM4	P06174	275 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	MRPL6	P32904	214 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	MAM33	P40513	266 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	YIA6	P40556	373 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	HIT1	P46973	164 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	CPD1	P53314	239 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	YPR091C	Q06833	770 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	SNA4	Q07549	140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATG18	YFR021W	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63

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