RNA–Protein interactions for RNA: YER148W

SPT15, Transcript of TATA-binding protein, yeast

Gene SPT15, Length 723 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPT15	YER148W	BLI1	P35727	113 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SPT15	YER148W	UTH1	P36135	365 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SPT15	YER148W	YPR078C	Q06813	372 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SPT15	YER148W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SPT15	YER148W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SPT15	YER148W	DEP1	P31385	405 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SPT15	YER148W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SPT15	YER148W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SPT15	YER148W	ECM8	P38246	354 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SPT15	YER148W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SPT15	YER148W	KEG1	P43614	200 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SPT15	YER148W	YNR068C	P53754	272 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SPT15	YER148W	LIP2	Q06005	328 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SPT15	YER148W	FRE6	Q12473	712 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SPT15	YER148W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SPT15	YER148W	RDS1	P25611	832 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SPT15	YER148W	VAM7	P32912	316 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SPT15	YER148W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SPT15	YER148W	MRP21	P38175	177 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SPT15	YER148W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SPT15	YER148W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SPT15	YER148W	PEX27	Q08580	376 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SPT15	YER148W	HIF1	Q12373	385 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SPT15	YER148W	STE7	P06784	515 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	PRB1	P09232	635 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	RPL43B	P0CX26	92 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	MAS1	P10507	462 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	ZRC1	P20107	442 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	GIT1	P25346	518 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	MSK1	P32048	576 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	HMT1	P38074	348 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	MED6	P38782	295 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	SEC9	P40357	651 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	MPS2	P53159	387 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	GAT3	Q07928	141 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	YPL278C	Q08990	100 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	HMS1	Q12398	434 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	SFG1	Q12507	346 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	COX4	P04037	155 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	HAP2	P06774	265 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	DPH2	P32461	534 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	SWI3	P32591	825 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	TIM17	P39515	158 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	CIN2	P46670	268 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	SUE1	Q06524	206 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	SHS1	Q07657	551 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	MCT1	Q12283	360 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	SFM1	Q12314	213 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	GPI18	P38211	433 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	VHT1	P53241	593 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	YMR010W	Q03687	405 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	YOR338W	Q99326	363 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	LAA1	P39526	2014 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	HEM4	P06174	275 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	GRR1	P24814	1151 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	IES6	P32617	166 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	YKR015C	P36111	568 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	VAC7	P53950	1165 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	MSC3	Q05812	728 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	FSH3	Q99369	266 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	MEC1	P38111	2368 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	COQ1	P18900	473 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	FAR1	P21268	830 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	LDS1	P31379	325 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	CYM1	P32898	989 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	MID2	P36027	376 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	PFS1	P38872	237 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	SNL1	P40548	159 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	IGD1	P43598	195 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	EFM3	P47163	339 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	YPS5	P53057	165 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	YNL143C	P53908	130 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	MRPS16	Q02608	121 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPT15	YER148W	CSI1	Q04368	295 aa		3.11	□□□□□ -1.91

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