RNA–Protein interactions for RNA: YDR369C

XRS2, Transcript of Protein required for DNA repair, yeast

Gene XRS2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	YDR369C	FRT1	Q99332	602 aa		3.41	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	COX5B	P00425	151 aa		3.4	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	ZRC1	P20107	442 aa		3.4	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PHO91	P27514	894 aa		3.4	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YPT53	P36019	220 aa		3.4	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SDH4	P37298	181 aa		3.4	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	RIB5	P38145	238 aa		3.4	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YBR053C	P38235	358 aa		3.4	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	CHS7	P38843	316 aa		3.4	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	FET3	P38993	636 aa		3.4	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SNM1	P40993	198 aa		3.4	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	BAP3	P41815	604 aa		3.4	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	FIG4	P42837	879 aa		3.4	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	GCV1	P48015	400 aa		3.4	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YGL159W	P53110	370 aa		3.4	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	ROG1	P53118	685 aa		3.4	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YGR151C	P53287	111 aa		3.4	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YGR273C	P53329	174 aa		3.4	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	BUD17	P53727	317 aa		3.4	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YDR366C	P87287	132 aa		3.4	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YMR130W	Q04223	302 aa		3.4	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	GTO3	Q04806	366 aa		3.4	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	GUD1	Q07729	489 aa		3.4	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	YOL159C	Q08300	171 aa		3.4	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	SUL2	Q12325	893 aa		3.4	□□□□□ -1.86
XRS2	YDR369C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	HAP3	P13434	144 aa		3.4	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.4	□□□□□ -1.87	not detected
XRS2	YDR369C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	PET18	P25362	215 aa		3.4	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	VAC17	P25591	423 aa		3.4	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	SUA5	P32579	426 aa		3.4	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YEF1	P32622	495 aa		3.4	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	DOA1	P36037	715 aa		3.4	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YKL075C	P36083	450 aa		3.4	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YHR035W	P38769	630 aa		3.4	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	MDM31	P38880	579 aa		3.4	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	FAD1	P38913	306 aa		3.4	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YAR028W	P39548	234 aa		3.4	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	MEP3	P53390	489 aa		3.4	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YNR066C	P53752	436 aa		3.4	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	UGO1	Q03327	502 aa		3.4	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YMR209C	Q03648	457 aa		3.4	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	CSM3	Q04659	317 aa		3.4	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	AIM32	Q04689	311 aa		3.4	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YDR222W	Q04925	415 aa		3.4	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	DUS4	Q06063	367 aa		3.4	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	GPI11	Q06636	219 aa		3.4	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	MDY2	Q12285	212 aa		3.4	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	KCS1	Q12494	1050 aa		3.4	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	PRM4	Q12498	284 aa		3.4	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	AI1	P03875	834 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ASP3-2	P0CX77	362 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ASP3-3	P0CX78	362 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ASP3-4	P0CX79	362 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	GEX1	P25596	615 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YCR102C	P25608	368 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	AFG1	P32317	509 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YKU70	P32807	602 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YPC1	P38298	316 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	SPL2	P38839	148 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	LCB2	P40970	561 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	PMT6	P42934	759 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	GWT1	P47026	490 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	PHO23	P50947	330 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	RNH202	Q05635	350 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	SKG3	Q06315	1026 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YDR018C	Q12185	396 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ATG5	Q12380	294 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	CDC34	P14682	295 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ERD1	P16151	362 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	AFT1	P22149	690 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	PEX34	P25584	144 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YCR061W	P25639	631 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	MET22	P32179	357 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	RML2	P32611	393 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	CLB6	P32943	380 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ROT2	P38138	954 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	DBP8	P38719	431 aa		3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	SKN7	P38889	622 aa		3.39	□□□□□ -1.87

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