RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-217ENST00000629983 PRR23AA6NEV1 266 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAMTS3O15072 1205 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF862O60290 1169 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 EPCAMP16422 314 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 LONRF3Q496Y0 759 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 PLCD3Q8N3E9 789 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 FLCNQ8NFG4 579 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBP1Q9H171 429 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 ESYT2A0FGR8 921 aa30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 ADD1P35611 737 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 CABP7Q86V35 215 aa30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 ZMYND12Q9H0C1 365 aa30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 NBL1P41271 181 aa30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 TMC5Q6UXY8 1006 aa30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 GNA11P29992 359 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 GIT2Q14161 759 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 UGCGQ16739 394 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 FRMD5Q7Z6J6 570 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 LPPQ93052 612 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 GBP3Q9H0R5 595 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 USTQ9Y2C2 406 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 GAS7O60861 476 aa30.84■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 CTSAP10619 480 aa30.84■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXK2Q01167 660 aa30.84■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 ADCK5Q3MIX3 580 aa30.84■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 GLB1LQ6UWU2 654 aa30.84■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP26B1Q9NR63 512 aa30.84■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 CARNS1A5YM72 827 aa30.83■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP30.83■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 CIITAP33076 1130 aa30.83■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 PHKA2P46019 1235 aa30.83■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 RCAN1P53805 252 aa30.83■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 MTERF2Q49AM1 385 aa30.83■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 IGSF21Q96ID5 467 aa30.83■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 TEKT3Q9BXF9 490 aa30.83■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 CHST12Q9NRB3 414 aa30.83■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
CAPNS1-217ENST00000629983 CLCN5P51795 746 aa30.82■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 JAK3P52333 1124 aa30.82■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 DRP2Q13474 957 aa30.82■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC149Q6ZUS6 474 aa30.82■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 BICD2Q8TD16 824 aa30.82■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 LENG9Q96B70 501 aa30.82■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC136Q96JN2 1154 aa30.82■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 CFAP54Q96N23 3096 aa30.82■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 PLXNA3P51805 1871 aa30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A087WZ62 844 aa30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 MSH4O15457 936 aa30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 SKIP12755 728 aa30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 SFNP31947 248 aa30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 DNM2P50570 870 aa30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT32Q14532 448 aa30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 NOMO2Q5JPE7 1267 aa30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 LRCH2Q5VUJ6 765 aa30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 PPFIBP1Q86W92 1011 aa30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 RASEFQ8IZ41 740 aa30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC22A17Q8WUG5 538 aa30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 RSPH1Q8WYR4 309 aa30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 UNC45AQ9H3U1 944 aa30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 SFXN1Q9H9B4 322 aa30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D13Q9NVG8 400 aa30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXL21Q9UKT6 434 aa30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 IRAK3Q9Y616 596 aa30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 RIT2Q99578 217 aa30.8■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 GALTP07902 379 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 CDC42EP1Q00587 391 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 OTOP3Q7RTS5 596 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 MIER3Q7Z3K6 550 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC148Q8NFR7 591 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 KLRC2P26717 231 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPN14Q15678 1187 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 CATSPER4Q7RTX7 472 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 FEZF2Q8TBJ5 459 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 PHKBQ93100 1093 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 GJA10Q969M2 543 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-217ENST00000629983 SH2D3AQ9BRG2 576 aa30.78■■■□□ 2.52
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