RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591760.5

PTPRS-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRS, Length 478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-209ENST00000591760 TMEM143Q96AN5 459 aa28.73■■■□□ 2.19
PTPRS-209ENST00000591760 MTRQ99707 1265 aa28.73■■■□□ 2.19
PTPRS-209ENST00000591760 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
PTPRS-209ENST00000591760 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
PTPRS-209ENST00000591760 ANKEF1Q9NU02 776 aa28.73■■■□□ 2.19
PTPRS-209ENST00000591760 ZBTB39O15060 712 aa28.72■■■□□ 2.19
PTPRS-209ENST00000591760 GRM6O15303 877 aa28.72■■■□□ 2.19
PTPRS-209ENST00000591760 FGFR1P11362 822 aa28.72■■■□□ 2.19
PTPRS-209ENST00000591760 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP28.72■■■□□ 2.19
PTPRS-209ENST00000591760 ECHDC2Q86YB7 292 aa28.72■■■□□ 2.19
PTPRS-209ENST00000591760 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
PTPRS-209ENST00000591760 AAASQ9NRG9 546 aa28.72■■■□□ 2.19
PTPRS-209ENST00000591760 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa28.71■■■□□ 2.19
PTPRS-209ENST00000591760 A0A0U1RQF3 1178 aa28.71■■■□□ 2.19
PTPRS-209ENST00000591760 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
PTPRS-209ENST00000591760 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
PTPRS-209ENST00000591760 ABI1Q8IZP0 508 aa28.71■■■□□ 2.19
PTPRS-209ENST00000591760 TMEM117Q9H0C3 514 aa28.71■■■□□ 2.19
PTPRS-209ENST00000591760 IFT122Q9HBG6 1241 aa28.71■■■□□ 2.19
PTPRS-209ENST00000591760 PLAGL2Q9UPG8 496 aa28.71■■■□□ 2.19
PTPRS-209ENST00000591760 ASAP2O43150 1006 aa28.7■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 DGAT1O75907 488 aa28.7■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 TECP42680 631 aa28.7■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa28.7■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 CATSPER4Q7RTX7 472 aa28.7■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 ERMNQ8TAM6 284 aa28.7■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa28.7■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 TUFT1Q9NNX1 390 aa28.7■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa28.7■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 EOMESO95936 686 aa28.69■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa28.69■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 FERMT3Q86UX7 667 aa28.69■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 KLHL23Q8NBE8 558 aa28.69■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 RNF169Q8NCN4 708 aa28.69■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 TRAIPQ9BWF2 469 aa28.69■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 ITGB1P05556 798 aa28.68■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa28.68■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP28.68■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 RARRES1P49788 294 aa28.68■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 KCNQ1P51787 676 aa28.68■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa28.68■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 TCEAL5Q5H9L2 206 aa28.68■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 LRRC43Q8N309 656 aa28.68■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 TTC28Q96AY4 2481 aa28.67■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa28.67■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 SKIP12755 728 aa28.67■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 CATSPER3Q86XQ3 398 aa28.67■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 RNF149Q8NC42 400 aa28.67■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 PIGOQ8TEQ8 1089 aa28.67■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 CASD1Q96PB1 797 aa28.67■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa28.67■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa28.67■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 RNF19AQ9NV58 838 aa28.67■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 BMP1P13497 986 aa28.66■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 LAG3P18627 525 aa28.66■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 GJB2P29033 226 aa28.66■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 PHKA2P46019 1235 aa28.66■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 RAB27AP51159 221 aa28.66■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 TFDP1Q14186 410 aa28.66■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 NBR1Q14596 966 aa28.66■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 HAUS3Q68CZ6 603 aa28.66■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa28.66■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP28.65■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 MCTP1Q6DN14 999 aa28.65■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa28.65■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 SPPL3Q8TCT6 385 aa28.65■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 RSPH1Q8WYR4 309 aa28.65■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 NACC1Q96RE7 527 aa28.65■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 CWH43Q9H720 699 aa28.65■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 BRWD1Q9NSI6 2320 aa28.65■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 MUC3AQ02505 3323 aa28.64■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 NCK2O43639 380 aa28.64■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 MED24O75448 989 aa28.64■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 CSPG5O95196 566 aa28.64■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 RPA1P27694 616 aa28.64■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 UBE3AQ05086 875 aa28.64■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP28.64■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 CLLU1OSQ5K130 101 aa28.64■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 THNSL1Q8IYQ7 743 aa28.64■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 POF1BQ8WVV4 589 aa28.64■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 PPP2R3CQ969Q6 453 aa28.64■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 FAM105AQ9NUU6 356 aa28.64■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 HCSTQ9UBK5 93 aa28.64■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 SMC3Q9UQE7 1217 aa28.64■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
PTPRS-209ENST00000591760 H3BQV1 296 aa28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms