RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566637.5

CTU2-208, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTU2, Length 1,619 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-208ENST00000566637 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 ITIH6Q6UXX5 1313 aa22.6■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 DENND3A2RUS2 1198 aa22.6■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 ADCY6O43306 1168 aa22.6■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 TRPA1O75762 1119 aa22.6■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 PBX1P40424 430 aa22.6■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 NAMPTP43490 491 aa22.6■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 MARSP56192 900 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 PTPN21Q16825 1174 aa22.6■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 IER5Q5VY09 327 aa22.6■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 DEPTORQ8TB45 409 aa22.6■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.6■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.6■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.6■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 TBX20Q9UMR3 447 aa22.6■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 COL1A2P08123 1366 aa22.59■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 PRKCZQ05513 592 aa22.59■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 VWA3BQ502W6 1294 aa22.59■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 CEP135Q66GS9 1140 aa22.59■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.59■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.59■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 Q9Y3F1 56 aa22.59■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 ZBTB42B2RXF5 422 aa22.58■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 AKR1A1P14550 325 aa22.58■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 GLRA2P23416 452 aa22.58■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 MYBPC2Q14324 1141 aa22.58■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 MIIPQ5JXC2 388 aa22.58■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 FRMD5Q7Z6J6 570 aa22.58■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.58■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 MAP4K3Q8IVH8 894 aa22.58■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.58■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.58■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa22.58■■□□□ 1.21
CTU2-208ENST00000566637 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.58■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 A0A1W2PQC6 194 aa22.57■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.57■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 H3BRB1 525 aa22.57■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 TPM1P09493 284 aa22.57■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 HOXD10P28358 340 aa22.57■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 TRIB2Q92519 343 aa22.57■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 IKZF4Q9H2S9 585 aa22.57■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa22.57■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.57■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa22.57■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 A6NJR5 290 aa22.57■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 INSRRP14616 1297 aa22.57■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 CPT1AP50416 773 aa22.57■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 CYP2J2P51589 502 aa22.57■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 C1QTNF8P60827 252 aa22.57■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 TRIM14Q14142 442 aa22.57■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 SLC9A9Q8IVB4 645 aa22.57■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 RETREG2Q8NC44 543 aa22.57■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 MKNK1Q9BUB5 465 aa22.57■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 NDST4Q9H3R1 872 aa22.57■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.56■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.56■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 MAGEB2O15479 319 aa22.56■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 NRDCO43847 1150 aa22.56■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 IGBP1P78318 339 aa22.56■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.56■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 STRN3Q13033 797 aa22.56■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.56■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 LRRC8AQ8IWT6 810 aa22.56■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.56■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.56■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 KCNF1Q9H3M0 494 aa22.56■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 DMAC2Q9NW81 257 aa22.56■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 AKAP3O75969 853 aa22.55■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 CYBAP13498 195 aa22.55■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 ARMCX5Q6P1M9 558 aa22.55■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 FAM186BQ8IYM0 893 aa22.55■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 LRRC71Q8N4P6 559 aa22.55■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 BICD1Q96G01 975 aa22.55■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 EXOC3O60645 756 aa22.54■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 C22orf31O95567 290 aa22.54■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 PPFIA1Q13136 1202 aa22.54■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 CAPSQ13938 189 aa22.54■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 ARID5BQ14865 1188 aa22.54■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 EFCAB12Q6NXP0 572 aa22.54■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.54■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CTU2-208ENST00000566637 KCNN1Q92952 543 aa22.54■■□□□ 1.2
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