RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549279.1

TPCN1-212, Transcript of two pore segment channel 1, humanhuman

TSL 4

Gene TPCN1, Length 544 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1-212ENST00000549279 LPXNO60711 386 aa22.43■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 FAM189BP81408 668 aa22.43■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.43■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 BRAPQ7Z569 592 aa22.43■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.43■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 IGSF22Q8N9C0 903 aa22.43■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.43■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.43■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.42■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 CTNNB1P35222 781 aa22.42■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 TFDP1Q14186 410 aa22.42■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 POTEGQ6S5H5 508 aa22.42■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.42■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 RNF149Q8NC42 400 aa22.42■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 H3BNC9 293 aa22.41■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 HOXA2O43364 376 aa22.41■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 RB1P06400 928 aa22.41■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 BMPR1AP36894 532 aa22.41■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 PHKA2P46019 1235 aa22.41■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 KRT79Q5XKE5 535 aa22.41■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.41■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 A0A087WWV3 80 aa22.4■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 A0A0U1RQF3 1178 aa22.4■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 ARHGEF35A5YM69 484 aa22.4■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.4■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 GPM6BQ13491 265 aa22.4■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 PTPROQ16827 1216 aa22.4■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 ECHDC2Q86YB7 292 aa22.4■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.4■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 SNX21Q969T3 373 aa22.4■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
TPCN1-212ENST00000549279 TBKBP1A7MCY6 615 aa22.39■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 LINC00271P0C7V0 271 aa22.39■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 SKIP12755 728 aa22.39■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 ARL2P36404 184 aa22.39■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 GATMP50440 423 aa22.39■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 POU5F1BQ06416 359 aa22.39■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.39■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 TRAIPQ9BWF2 469 aa22.39■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 PLVAPQ9BX97 442 aa22.39■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 EOMESO95936 686 aa22.38■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 BMP15O95972 392 aa22.38■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 HSCBQ8IWL3 235 aa22.38■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 ABI1Q8IZP0 508 aa22.38■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.38■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.38■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 TRANK1O15050 2925 aa22.38■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 ERLIN2O94905 339 aa22.37■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 FGFR1P11362 822 aa22.37■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 SYT1P21579 422 aa22.37■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 RAB27AP51159 221 aa22.37■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 PTENP60484 403 aa22.37■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 IL17AQ16552 155 aa22.37■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 NAALADL2Q58DX5 795 aa22.37■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 PADI6Q6TGC4 694 aa22.37■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 RNF169Q8NCN4 708 aa22.37■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.37■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 P2RX5Q93086 422 aa22.37■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.37■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.37■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.37■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 VWA3AA6NCI4 1184 aa22.36■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 GLRA2P23416 452 aa22.36■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 CAPSQ13938 189 aa22.36■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 ECM1Q16610 540 aa22.36■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 MAEAQ7L5Y9 396 aa22.36■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 NFKBIZQ9BYH8 718 aa22.36■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.36■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 BHMT2Q9H2M3 363 aa22.36■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 AAASQ9NRG9 546 aa22.36■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 THEGQ9P2T0 379 aa22.36■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 DNM3Q9UQ16 869 aa22.36■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 PP2D1A8MPX8 630 aa22.35■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.35■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 CYP11B2P19099 503 aa22.35■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 RSPH1Q8WYR4 309 aa22.35■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 FAM105AQ9NUU6 356 aa22.35■■□□□ 1.17
TPCN1-212ENST00000549279 KIAA1671Q9BY89 1806 aa22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms