RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 STAT5BP51692 787 aa11.67□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RING1Q06587 406 aa11.67□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MTMR1Q13613 665 aa11.67□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC35G1Q2M3R5 365 aa11.67□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LAIR1Q6GTX8 287 aa11.67□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 METTL13Q8N6R0 699 aa11.67□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NELL1Q92832 810 aa11.67□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FGF14Q92915 247 aa11.67□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAD2L2Q9UI95 211 aa11.67□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AKAP13Q12802 2813 aa11.67□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A0D9SFI3 127 aa11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANHXE9PGG2 379 aa11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PCP11498 1178 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPINK2P20155 84 aa11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MTAPQ13126 283 aa11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CSRP2Q16527 193 aa11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC178Q5BJE1 867 aa11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PARM1Q6UWI2 310 aa11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPRASP2Q96D09 838 aa11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDHR1Q96JP9 859 aa11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LTB4R2Q9NPC1 389 aa11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HELLSQ9NRZ9 838 aa11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC9A2Q9UBY0 812 aa11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MIA3Q5JRA6 1907 aa11.66□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TTC41PQ6P2S7 1318 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LOC400499M0QZD8 3231 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF213O14771 459 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GALTP07902 379 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FGFR4P22455 802 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TARSP26639 723 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AK2P54819 239 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACTR2P61160 394 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRAF1Q13077 416 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC6Q16204 474 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CUL5Q93034 780 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LPPQ93052 612 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PHKBQ93100 1093 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZSWIM5Q9P217 1185 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNAJB4Q9UDY4 337 aa11.65□□□□□ -0.54
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LAMA4Q16363 1823 aa11.65□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa11.64□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BACH1O14867 736 aa11.64□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CYTH3O43739 400 aa11.64□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPR32O75388 356 aa11.64□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC11A1P49279 550 aa11.64□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRKCQQ04759 706 aa11.64□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TPRG1Q6ZUI0 275 aa11.64□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa11.64□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PALB2Q86YC2 1186 aa11.64□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBAC1Q9BSL1 405 aa11.64□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PATJQ8NI35 1801 aa11.64□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LAMA1P25391 3075 aa11.64□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAST4O15021 2626 aa11.64□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A0U1RQF3 1178 aa11.63□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MEIS2O14770 477 aa11.63□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRP3O75074 770 aa11.63□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GLUD1P00367 558 aa11.63□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FOXC1Q12948 553 aa11.63□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OSBPL6Q9BZF3 934 aa11.63□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RXFP3Q9NSD7 469 aa11.63□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TBC1D13Q9NVG8 400 aa11.63□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AKT3Q9Y243 479 aa11.63□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BPTFQ12830 3046 aa11.63□□□□□ -0.55
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MEIS3P2A8K0S8 358 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms