RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504927.5

DDR1-255, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene DDR1, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1-255ENST00000504927 USP28Q96RU2 1077 aa22.96■■□□□ 1.27
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DDR1-255ENST00000504927 PHKA2P46019 1235 aa22.95■■□□□ 1.26
DDR1-255ENST00000504927 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
DDR1-255ENST00000504927 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
DDR1-255ENST00000504927 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
DDR1-255ENST00000504927 DSC3Q14574 896 aa22.95■■□□□ 1.26
DDR1-255ENST00000504927 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
DDR1-255ENST00000504927 ATL3Q6DD88 541 aa22.95■■□□□ 1.26
DDR1-255ENST00000504927 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.95■■□□□ 1.26
DDR1-255ENST00000504927 LINC01599Q8WXQ3 324 aa22.95■■□□□ 1.26
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DDR1-255ENST00000504927 E9PMD0 336 aa22.94■■□□□ 1.26
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DDR1-255ENST00000504927 FAM189BP81408 668 aa22.94■■□□□ 1.26
DDR1-255ENST00000504927 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.94■■□□□ 1.26
DDR1-255ENST00000504927 CRIPAKQ8N1N5 446 aa22.94■■□□□ 1.26
DDR1-255ENST00000504927 NFKBIZQ9BYH8 718 aa22.94■■□□□ 1.26
DDR1-255ENST00000504927 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
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DDR1-255ENST00000504927 MICAL3Q7RTP6 2002 aa22.93■■□□□ 1.26
DDR1-255ENST00000504927 C9IYK1 514 aa22.93■■□□□ 1.26
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DDR1-255ENST00000504927 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
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DDR1-255ENST00000504927 GRB10Q13322 594 aa22.92■■□□□ 1.26
DDR1-255ENST00000504927 STK38Q15208 465 aa22.92■■□□□ 1.26
DDR1-255ENST00000504927 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.92■■□□□ 1.26
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DDR1-255ENST00000504927 MAEAQ7L5Y9 396 aa22.92■■□□□ 1.26
DDR1-255ENST00000504927 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
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DDR1-255ENST00000504927 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
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DDR1-255ENST00000504927 CSRNP2Q9H175 543 aa22.92■■□□□ 1.26
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DDR1-255ENST00000504927 GRIN1Q05586 938 aa22.91■■□□□ 1.26
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DDR1-255ENST00000504927 LCHNA4D1U4 455 aa22.9■■□□□ 1.26
DDR1-255ENST00000504927 PPP6R2O75170 966 aa22.9■■□□□ 1.26
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DDR1-255ENST00000504927 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.88■■□□□ 1.25
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DDR1-255ENST00000504927 ERLIN2O94905 339 aa22.88■■□□□ 1.25
DDR1-255ENST00000504927 PLA2G4BP0C869 781 aa22.88■■□□□ 1.25
DDR1-255ENST00000504927 GUCY2CP25092 1073 aa22.88■■□□□ 1.25
DDR1-255ENST00000504927 NAMPTP43490 491 aa22.88■■□□□ 1.25
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