RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 PTPN21Q16825 1174 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 RGL3Q3MIN7 710 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 TOR2AQ5JU69 321 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 GPR155Q7Z3F1 870 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 LYSMD2Q8IV50 215 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 TOX2Q96NM4 488 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 ORAI2Q96SN7 254 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 FBXO10Q9UK96 956 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 DNMBPQ6XZF7 1577 aa4.4□□□□□ -1.7
RABGGTB-211ENST00000489450 SHTN1A0MZ66 631 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 CUTAO60888 179 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 ALDH1L1O75891 902 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 HMGCRP04035 888 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 OSMP13725 252 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 ETV4P43268 484 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 RRADP55042 308 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 LGALS4P56470 323 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 CLUL1Q15846 466 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM26FQ5R3K3 315 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 ODR4Q5SWX8 454 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 PGM2L1Q6PCE3 622 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 Q6ZUG5 572 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 IFNL2Q8IZJ0 200 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 CDYL2Q8N8U2 506 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 AJUBAQ96IF1 538 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 DYDC2Q96IM9 177 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 HAPLN2Q9GZV7 340 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 WNT8AQ9H1J5 351 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 DNAJC28Q9NX36 388 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 MKS1Q9NXB0 559 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 PRSS50Q9UI38 385 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 DNAI1Q9UI46 699 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 PTPN22Q9Y2R2 807 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 ZDHHC9Q9Y397 364 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 NUMBLQ9Y6R0 609 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC88BA6NC98 1476 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 LMTK3Q96Q04 1460 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 ADAMTS20P59510 1910 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM75PA6NK02 468 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHGA12O60330 932 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 S100BP04271 92 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 CSF2RBP32927 897 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 NEK2P51955 445 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 CCT2P78371 535 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 CDK17Q00537 523 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 GAREM2Q75VX8 874 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 KCNK18Q7Z418 384 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 REXO1L1PQ8IX06 675 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 AMOTL1Q8IY63 956 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 KLHL36Q8N4N3 616 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 GAB3Q8WWW8 586 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 MBD6Q96DN6 1003 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 FAXDC2Q96IV6 333 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 HIST1H2AJQ99878 128 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 SOX7Q9BT81 388 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 KATNBL1Q9H079 304 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 KLHL42Q9P2K6 505 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 DPP7Q9UHL4 492 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 ADAM29Q9UKF5 820 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 CDY2AQ9Y6F7 541 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 MROH6A6NGR9 719 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 C9orf118A6NHY6 69 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 MAFGO15525 162 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 XPOTO43592 962 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIM13O60858 407 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 CFBP00751 764 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 RBP3P10745 1247 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-211ENST00000489450 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms