RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 HHIPL2Q6UWX4 724 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 EP400NLQ6ZTU2 488 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 FBXW5Q969U6 566 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 LOXL4Q96JB6 756 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 EXOC2Q96KP1 924 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 SNTG2Q9NY99 539 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 ZFP69BQ9UJL9 534 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 NUDCQ9Y266 331 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 LRP6O75581 1613 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 CPDO75976 1380 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 INSRP06213 1382 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 COL18A1P39060 1754 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 SUV39H1O43463 412 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 LAMTOR5O43504 91 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 B4GALT3O60512 393 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 APPP05067 770 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 CKMP06732 381 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 PYGMP11217 842 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 SERINC3Q13530 473 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 PHACTR3Q96KR7 559 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 DRC1Q96MC2 740 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 ZDHHC9Q9Y397 364 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 SHPRHQ149N8 1683 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 KRT15P19012 456 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 PRKAR2BP31323 418 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 EPHA5P54756 1037 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 PFKPQ01813 784 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 NFATC3Q12968 1075 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 GPR19Q15760 415 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 FAM47CQ5HY64 1035 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 BTBD8Q5XKL5 378 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 NLGN4XQ8N0W4 816 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 STPG3Q8N7X2 389 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 SH3RF2Q8TEC5 729 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 NUDT11Q96G61 164 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 JADE2Q9NQC1 790 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 NDOR1Q9UHB4 597 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 RTL1A6NKG5 1358 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF839A8K0R7 811 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 ARVCFO00192 962 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 APAF1O14727 1248 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 COL6A1P12109 1028 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 CRY1Q16526 586 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 LONRF2Q1L5Z9 754 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 CHST13Q8NET6 341 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 MBD6Q96DN6 1003 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 AFF2P51816 1311 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 LMO7Q8WWI1 1683 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC66A2RUB6 948 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 ACOT7O00154 380 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 GSTA4O15217 222 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 CRTAMO95727 393 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 PDE6AP16499 860 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 DNM2P50570 870 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 FIGNQ5HY92 759 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 LRP10Q7Z4F1 713 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-211ENST00000484135 UNC5CLQ8IV45 518 aa6.13□□□□□ -1.43
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