RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 FOXO6A8MYZ6 492 aa17.51■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 GHRP10912 638 aa17.51■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 SEMA3FQ13275 785 aa17.51■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 SLC18A3Q16572 532 aa17.51■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP17.51■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 H0YGN5 161 aa17.51■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 EDIL3O43854 480 aa17.51■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 CCND1P24385 295 aa17.51■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 HSPA1LP34931 641 aa17.51■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 MSH2P43246 934 aa17.51■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 UBXN2AP68543 259 aa17.51■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 QRICH1Q2TAL8 776 aa17.51■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 BAP1Q92560 729 aa17.51■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 NFS1Q9Y697 457 aa17.51■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 PMS2P54278 862 aa17.5■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 C3orf20Q8ND61 904 aa17.5■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 CERKQ8TCT0 537 aa17.5■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 COA1Q9GZY4 146 aa17.5■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 EBF2Q9HAK2 575 aa17.5■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 GAKO14976 1311 aa17.5■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 ACSL3O95573 720 aa17.5■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 CRKP46108 304 aa17.5■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 TEKT4Q8WW24 435 aa17.5■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 MTMR9Q96QG7 549 aa17.5■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM4Q9C037 500 aa17.5■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 POTEFA5A3E0 1075 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 TLR2O60603 784 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 POTEIP0CG38 1075 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 PDE6CP51160 858 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 MUM1Q2TAK8 710 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 FIGNQ5HY92 759 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 POTEGQ6S5H5 508 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 POTEEQ6S8J3 1075 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 RAD54LQ92698 747 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 SLFN13Q68D06 897 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 SP8Q8IXZ3 490 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 LTBP4Q8N2S1 1624 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 DPPA5A6NC42 116 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 ATP4AP20648 1035 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 GBP1P32455 592 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 NCALDP61601 193 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 DR1Q01658 176 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 PTK2Q05397 1052 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 PROM2Q8N271 834 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 HAS1Q92839 578 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 PBKQ96KB5 322 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM7Q9C029 511 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 FAM114A2Q9NRY5 505 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 LAMB1P07942 1786 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 RASGRF2O14827 1237 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 ZBTB5O15062 677 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 PJA2O43164 708 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 ADRA2BP18089 450 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 UNC13DQ70J99 1090 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 VPS36Q86VN1 386 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 GPBP1Q86WP2 473 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 RAB17Q9H0T7 212 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 SEMA4AQ9H3S1 761 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 CUEDC2Q9H467 287 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 BCAS3Q9H6U6 928 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 NR2E1Q9Y466 385 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 CHMP2AO43633 222 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 CHRNA5P30532 468 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 GABPAQ06546 454 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 HGSNATQ68CP4 663 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 FBXO25Q8TCJ0 367 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 KLHL14Q9P2G3 628 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 STX2P32856 288 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 COPS2P61201 443 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 LONRF1Q17RB8 773 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM154Q6P9G4 183 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 CRAMP1Q96RY5 1269 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 AMFRQ9UKV5 643 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 SFI1A8K8P3 1242 aa17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms