RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466278.1

MKL1-208, Transcript of MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene MKL1, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1-208ENST00000466278 TMEM117Q9H0C3 514 aa25.47■■□□□ 1.67
MKL1-208ENST00000466278 TMEM60Q9H2L4 133 aa25.47■■□□□ 1.67
MKL1-208ENST00000466278 CHST12Q9NRB3 414 aa25.47■■□□□ 1.67
MKL1-208ENST00000466278 AAASQ9NRG9 546 aa25.47■■□□□ 1.67
MKL1-208ENST00000466278 PLAGL2Q9UPG8 496 aa25.47■■□□□ 1.67
MKL1-208ENST00000466278 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
MKL1-208ENST00000466278 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
MKL1-208ENST00000466278 KLHL23Q8NBE8 558 aa25.46■■□□□ 1.67
MKL1-208ENST00000466278 TCP11Q8WWU5 503 aa25.46■■□□□ 1.67
MKL1-208ENST00000466278 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
MKL1-208ENST00000466278 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa25.46■■□□□ 1.67
MKL1-208ENST00000466278 MUC3AQ02505 3323 aa25.45■■□□□ 1.67
MKL1-208ENST00000466278 A0A0U1RQF3 1178 aa25.45■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 ITGB1P05556 798 aa25.45■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 NOSTRINQ8IVI9 506 aa25.45■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 KSR1Q8IVT5 923 aa25.45■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 ABI1Q8IZP0 508 aa25.45■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 TMEM143Q96AN5 459 aa25.45■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 MTRQ99707 1265 aa25.45■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 POTEMA6NI47 508 aa25.44■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 TNFRSF10AO00220 468 aa25.44■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 TRAPPC10P48553 1259 aa25.44■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 CATSPER4Q7RTX7 472 aa25.44■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 IFT122Q9HBG6 1241 aa25.44■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 ANKEF1Q9NU02 776 aa25.44■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 RNF19AQ9NV58 838 aa25.44■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 KIF3AQ9Y496 699 aa25.44■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa25.44■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 ZBTB39O15060 712 aa25.43■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 EOMESO95936 686 aa25.43■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 OR52Z1P0C646 297 aa25.43■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 LAG3P18627 525 aa25.43■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 KCNA5P22460 613 aa25.43■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa25.43■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 COL19A1Q14993 1142 aa25.43■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.43■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 TTC38Q5R3I4 469 aa25.43■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 LRRC43Q8N309 656 aa25.43■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 RNF169Q8NCN4 708 aa25.43■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 SPPL3Q8TCT6 385 aa25.43■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 CASD1Q96PB1 797 aa25.43■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 TRAIPQ9BWF2 469 aa25.43■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 ASAP2O43150 1006 aa25.42■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 NCK2O43639 380 aa25.42■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 CSPG5O95196 566 aa25.42■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 LEXMQ3ZCV2 418 aa25.42■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa25.42■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa25.42■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 POF1BQ8WVV4 589 aa25.42■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 PPP2R3CQ969Q6 453 aa25.42■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 HCSTQ9UBK5 93 aa25.42■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 DGAT1O75907 488 aa25.41■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 SKIP12755 728 aa25.41■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 UBE3AQ05086 875 aa25.41■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 CAMK1Q14012 370 aa25.41■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 ZNF174Q15697 407 aa25.41■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 CLLU1OSQ5K130 101 aa25.41■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 FERMT3Q86UX7 667 aa25.41■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 CWH43Q9H720 699 aa25.41■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 TUFT1Q9NNX1 390 aa25.41■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa25.41■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa25.41■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa25.4■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 DNAJB1P25685 340 aa25.4■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.663e-6■■■□□ 16.2
MKL1-208ENST00000466278 PHKA2P46019 1235 aa25.4■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 RARRES1P49788 294 aa25.4■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 RAB27AP51159 221 aa25.4■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 THNSL1Q8IYQ7 743 aa25.4■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 RNF149Q8NC42 400 aa25.4■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 ERMNQ8TAM6 284 aa25.4■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 RSPH1Q8WYR4 309 aa25.4■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 TMX3Q96JJ7 454 aa25.4■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 TBC1D32Q96NH3 1257 aa25.4■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 TECP42680 631 aa25.39■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 MCM2P49736 904 aa25.39■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 HYAL1Q12794 435 aa25.39■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 EP400NLQ6ZTU2 488 aa25.39■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 HELQQ8TDG4 1101 aa25.39■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 CLDND1Q9NY35 253 aa25.39■■□□□ 1.66
MKL1-208ENST00000466278 FGF18O76093 207 aa25.38■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa25.38■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 TFDP1Q14186 410 aa25.38■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 LRRC55Q6ZSA7 311 aa25.38■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 PIGOQ8TEQ8 1089 aa25.38■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms