RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.233e-6■■□□□ 14.2
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RABGGTB-205ENST00000462042 FATE1Q969F0 183 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 PCDHGA12O60330 932 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 KLHL18O94889 574 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 ADCY8P40145 1251 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 LINC00310P59036 64 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 KCNA10Q16322 511 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 VWA3BQ502W6 1294 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 LYSMD2Q8IV50 215 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 JADE3Q92613 823 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC136Q96JN2 1154 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 TEKT5Q96M29 485 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM168Q9H0V1 697 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 IP6K2Q9UHH9 426 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 C9orf118A6NHY6 69 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 FSBPO95073 299 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM26FQ5R3K3 315 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 XP32Q5T750 250 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM180AQ6UWF9 173 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 LMBR1LQ6UX01 489 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 RELTQ969Z4 430 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 HSPBAP1Q96EW2 488 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 WDR92Q96MX6 357 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 FMNL2Q96PY5 1086 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 CSRNP2Q9H175 543 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTB-205ENST00000462042 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 SCGB1D2O95969 90 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 HMGCRP04035 888 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 OSMP13725 252 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC16A1P53985 500 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 ADKP55263 362 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
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RABGGTB-205ENST00000462042 NXNQ6DKJ4 435 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 KLHDC10Q6PID8 442 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 Q6ZUG5 572 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 CARFQ8N187 725 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 KLHL36Q8N4N3 616 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
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RABGGTB-205ENST00000462042 AJUBAQ96IF1 538 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 KATNBL1Q9H079 304 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
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RABGGTB-205ENST00000462042 GOLGA6BA6NDN3 693 aa7.32□□□□□ -1.24
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RABGGTB-205ENST00000462042 NDUFS2O75306 463 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 GOLGA6DP0CG33 693 aa7.32□□□□□ -1.24
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RABGGTB-205ENST00000462042 KCNQ1P51787 676 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 ANTXR2P58335 489 aa7.32□□□□□ -1.24
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RABGGTB-205ENST00000462042 ODF1Q14990 250 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 MUM1L1Q5H9M0 696 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM102BQ5T8I3 360 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 TRIM68Q6AZZ1 485 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 BTNL9Q6UXG8 535 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 TCEAL8Q8IYN2 117 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 RTKN2Q8IZC4 609 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 LINC01356Q8N9X3 169 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 TSPEARQ8WU66 669 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 NUDT11Q96G61 164 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 CARD11Q9BXL7 1154 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 PRDM12Q9H4Q4 367 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RABGGTB-205ENST00000462042 NPIPB6E9PJ23 425 aa7.31□□□□□ -1.24
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