RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460278.5

ANKRD28-205, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-205ENST00000460278 LRRC27Q9C0I9 530 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 SP110Q9HB58 689 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 KMT5AQ9NQR1 393 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 PDLIM7Q9NR12 457 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 FNIP2Q9P278 1114 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 HDAC9Q9UKV0 1011 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 TPCN1Q9ULQ1 816 aa4□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 PDS5BQ9NTI5 1447 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 H7BY64 318 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 M0R3H8 397 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 ADAMTS3O15072 1205 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 NCAM2O15394 837 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 FRS3O43559 492 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 PRAMEF1O95521 474 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 CBX7O95931 251 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 GLI1P08151 1106 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 TNFSF4P23510 183 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 CALRP27797 417 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 HTR1BP28222 390 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 BMP8BP34820 402 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 KIR3DL1P43629 444 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 RAP1GAPP47736 663 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 PRIM2P49643 509 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 RGS3P49796 1198 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 PRKG2Q13237 762 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 UGT8Q16880 541 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 ANO4Q32M45 955 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 NPNTQ6UXI9 565 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 CYP26C1Q6V0L0 522 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 C4orf50Q6ZRC1 276 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 BRINP3Q76B58 766 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 CCDC103Q8IW40 242 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 CMIPQ8IY22 773 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 NLGN4XQ8N0W4 816 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 DAGLBQ8NCG7 672 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 PPP1R35Q8TAP8 253 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 CXorf38Q8TB03 319 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 AUTS2Q8WXX7 1259 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 BRI3BPQ8WY22 251 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 FERMT2Q96AC1 680 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 CCDC120Q96HB5 630 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 MAML3Q96JK9 1138 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 TTC14Q96N46 770 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 BHMT2Q9H2M3 363 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 SMOC1Q9H4F8 434 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 ATP13A1Q9HD20 1204 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 DMRT3Q9NQL9 472 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 GPRC5BQ9NZH0 403 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 CLEC1BQ9P126 229 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 CBLCQ9ULV8 474 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 GPR52Q9Y2T5 361 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 TTLL3Q9Y4R7 772 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 NUB1Q9Y5A7 615 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 ARHGEF11O15085 1522 aa3.99□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 A0A087WV62 115 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 PRR33A8MZF0 331 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 ORC4O43929 436 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 MBD4O95243 580 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 TBC1D8O95759 1140 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 MYBP10242 640 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 GNAT1P11488 350 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 LCP1P13796 627 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 PDE6AP16499 860 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 ABCB4P21439 1286 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 SMARCA1P28370 1054 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 SSR1P43307 286 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 FNTBP49356 437 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 CASP5P51878 434 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 RPL11P62913 178 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 NUCB1Q02818 461 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 MESP2Q0VG99 397 aa3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
ANKRD28-205ENST00000460278 SNX17Q15036 470 aa3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms